42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2838 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2838  zinc finger, SWIM-type  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0806  zinc finger SWIM domain-containing protein  55.38 
 
 		 366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7278  zinc finger, SWIM-type  44.28 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0502304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1095  zinc finger, SWIM-type  50.18 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0606  zinc finger SWIM domain-containing protein  51.05 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000222918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0419  zinc finger SWIM domain protein  50.64 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4058  zinc finger SWIM domain-containing protein  47.9 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.304195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0842  zinc finger SWIM domain protein  39.61 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.506869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4353  hypothetical protein  77.78 
 
 		 236 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1236  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.18 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.724844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0052  zinc finger SWIM domain protein  31.08 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6254  zinc finger SWIM domain protein  35.4 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1197  zinc finger SWIM domain protein  33.99 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13835 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0903  hypothetical protein  32.86 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 		 1152 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3269  zinc finger SWIM domain protein  29.94 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.773769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0750  SWIM Zn-finger  29.94 
 
 		 277 aa  96.3  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2829  zinc finger SWIM domain protein  29.3 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12136  hypothetical protein  34.84 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.79135e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  29.55 
 
 		 1175 aa  93.6  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0457  zinc finger, SWIM-type  34.64 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.717379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3602  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.51 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1607  zinc finger SWIM domain protein  29.55 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3362  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.96 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0916312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1012  zinc finger SWIM domain protein  31.49 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1073  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.87 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1433  hypothetical protein  32.24 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0616369  normal  0.405263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3581  zinc finger SWIM domain protein  30.48 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  32.69 
 
 		 1185 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00491  hypothetical protein  29.19 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1358  hypothetical protein  30.25 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28391  hypothetical protein  27.71 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2176  hypothetical protein  27.33 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2440  zinc finger SWIM domain protein  28.67 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  29.59 
 
 		 1194 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0139  zinc finger SWIM domain-containing protein  27.49 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389812  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1868  zinc finger, SWIM-type  23.62 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1046  zinc finger SWIM domain protein  31.43 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0821435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3287  zinc finger SWIM domain protein  30.32 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03220  SWIM zinc finger-containing protein  23.74 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.396624  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1674  zinc finger, SWIM-type  23.97 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1216  zinc finger SWIM domain protein  25.34 
 
 		 265 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>