158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2583 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2583  flavodoxin FldA  100 
 
 		 171 aa  356  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.285717  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1584  flavodoxin FldA  58.58 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.914641  hitchhiker  0.00800437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2007  flavodoxin FldA  56.21 
 
 		 169 aa  213  8e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11561  flavodoxin FldA  49.7 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.140927 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14081  flavodoxin FldA  50.89 
 
 		 174 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0794  flavodoxin FldA  50.89 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0860679  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16491  flavodoxin FldA  50.89 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.360226 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13641  flavodoxin FldA  49.11 
 
 		 174 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1272  flavodoxin FldA  48.52 
 
 		 174 aa  173  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.468155  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13731  flavodoxin FldA  49.11 
 
 		 174 aa  173  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13431  flavodoxin FldA  49.11 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173599  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1356  flavodoxin FldA  46.78 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.267183 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87975  predicted protein  48.41 
 
 		 141 aa  134  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23658  flavodoxin  40.24 
 
 		 207 aa  126  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166611  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46972  flavodoxin  40 
 
 		 324 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0268  flavodoxin FldA  36.97 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1384  flavodoxin FldA  36.36 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000670293  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1573  flavodoxin FldA  36.36 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.698699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  37.65 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  34.16 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  32.76 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  32.74 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  32.94 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  36.05 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  36.05 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  36.05 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  36.05 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  36.05 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  36.05 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  36.05 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  36.05 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  33.92 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  35.47 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  33.33 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  35.54 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  34.76 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  34.13 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0076  flavodoxin FldA  33.33 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  34.13 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  35.37 
 
 		 168 aa  97.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  34.88 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  30.72 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0409  flavodoxin FldA  32.73 
 
 		 163 aa  97.4  8e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  34.13 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  33.72 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  34.13 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0376  flavodoxin FldA  36.42 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000140694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  33.53 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  35.62 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  31.36 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  32.93 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3276  flavodoxin FldB  34.3 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3213  flavodoxin FldB  34.3 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  32.94 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  32.93 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  32.93 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3381  flavodoxin FldB  34.3 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3173  flavodoxin FldA  32.52 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3201  flavodoxin FldB  34.3 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3279  flavodoxin FldB  34.3 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  34.88 
 
 		 172 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0079  flavodoxin  32.75 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  32.94 
 
 		 178 aa  94.4  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  34.88 
 
 		 172 aa  94  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  32.34 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  32.34 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  33.73 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  32.34 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0561  flavodoxin FldB  32.56 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  32.34 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  32.34 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  32.34 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  36 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0860  flavodoxin  34.94 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000640171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  33.72 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  32.34 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  32.34 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  32.34 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  32.34 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  30.64 
 
 		 169 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1910  flavodoxin FldA  34.34 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000190222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  31.74 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  31.74 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3186  hypothetical protein  32.75 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155637  normal  0.897165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  33.33 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  31.74 
 
 		 209 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  31.74 
 
 		 209 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  31.74 
 
 		 209 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  32.53 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  33.53 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1996  flavodoxin FldB  30.81 
 
 		 198 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  32.53 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  32.53 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  33.93 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  32.56 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  32.56 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  32.56 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  32.53 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  32.53 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  32.93 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>