140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46972 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_46972  flavodoxin  100 
 
 		 324 aa  669    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23658  flavodoxin  45.58 
 
 		 207 aa  165  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1272  flavodoxin FldA  46.24 
 
 		 174 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.468155  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13731  flavodoxin FldA  45.09 
 
 		 174 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13641  flavodoxin FldA  45.09 
 
 		 174 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0794  flavodoxin FldA  44.51 
 
 		 171 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0860679  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13431  flavodoxin FldA  45.09 
 
 		 174 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16491  flavodoxin FldA  44.51 
 
 		 206 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.360226 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14081  flavodoxin FldA  41.95 
 
 		 174 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11561  flavodoxin FldA  45.09 
 
 		 173 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.140927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  40.91 
 
 		 170 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1356  flavodoxin FldA  42.2 
 
 		 174 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.267183 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1584  flavodoxin FldA  43.27 
 
 		 169 aa  132  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.914641  hitchhiker  0.00800437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  42.22 
 
 		 177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2007  flavodoxin FldA  44.32 
 
 		 169 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  40.8 
 
 		 170 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  38.76 
 
 		 169 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  38.89 
 
 		 180 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2583  flavodoxin FldA  40 
 
 		 171 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.285717  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  40.56 
 
 		 171 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  41.04 
 
 		 168 aa  120  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  37.5 
 
 		 174 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  38.29 
 
 		 168 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  36.93 
 
 		 178 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  39.23 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3186  hypothetical protein  39.11 
 
 		 180 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155637  normal  0.897165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0510  flavodoxin FldA  37.64 
 
 		 176 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  40.74 
 
 		 177 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  38.2 
 
 		 215 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  38.25 
 
 		 175 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  39.23 
 
 		 175 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  38.2 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  38.2 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  38.2 
 
 		 176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  38.2 
 
 		 176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  38.2 
 
 		 176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  37.64 
 
 		 176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  38.2 
 
 		 176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  38.2 
 
 		 176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  38.2 
 
 		 176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  36.87 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  38.04 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  38.04 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  38.04 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  35.32 
 
 		 224 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  38.25 
 
 		 175 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  37.7 
 
 		 175 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  38.2 
 
 		 176 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  38.2 
 
 		 176 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  39.68 
 
 		 177 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  37.84 
 
 		 175 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  38.25 
 
 		 174 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  40.12 
 
 		 172 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  37.99 
 
 		 171 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  39.2 
 
 		 172 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  37.7 
 
 		 175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  38.12 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  38.12 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  38.12 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  35.8 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  37.64 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  38.64 
 
 		 172 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  37.64 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  39.77 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  39.77 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  39.77 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  37.1 
 
 		 175 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  39.77 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  39.77 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  39.77 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  39.77 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  39.77 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  39.77 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1910  flavodoxin FldA  37.7 
 
 		 175 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  39.31 
 
 		 172 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  37.5 
 
 		 176 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1457  flavodoxin FldA  32.22 
 
 		 186 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0874  flavodoxin  38.67 
 
 		 175 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  36.61 
 
 		 179 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  37.1 
 
 		 175 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  37.7 
 
 		 175 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4067  flavodoxin FldB  38.15 
 
 		 182 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  37.16 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119946  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  37.16 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  37.16 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  38.29 
 
 		 168 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87975  predicted protein  43.88 
 
 		 141 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  37.16 
 
 		 175 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  38.15 
 
 		 172 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  38.15 
 
 		 172 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  36.93 
 
 		 172 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  34.86 
 
 		 164 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  36.84 
 
 		 163 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4431  flavodoxin  33.9 
 
 		 175 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  37.57 
 
 		 172 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  35.12 
 
 		 162 aa  106  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3893  flavodoxin FldB  35.84 
 
 		 200 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.410227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  36.61 
 
 		 175 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  35.2 
 
 		 174 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  36.61 
 
 		 175 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000052046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>