180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1483 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  100 
 
 		 177 aa  356  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0510  flavodoxin FldA  57.95 
 
 		 176 aa  213  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  55.68 
 
 		 178 aa  210  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  52.84 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3186  hypothetical protein  53.76 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155637  normal  0.897165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1457  flavodoxin FldA  50.84 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  47.46 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  48.59 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  48.59 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  48.59 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  48.59 
 
 		 215 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  48.59 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  48.59 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  48.59 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  48.59 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  48.59 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  48.59 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  45.2 
 
 		 175 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  47.46 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  47.46 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  47.46 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  47.46 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  47.46 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  45.76 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  44.89 
 
 		 175 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  44.89 
 
 		 175 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  44.89 
 
 		 175 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  46.33 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  44.94 
 
 		 171 aa  150  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  45.45 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  44.07 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119946  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  44.07 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  44.07 
 
 		 175 aa  148  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2243  flavodoxin FldA  44.07 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000503169  decreased coverage  0.0000000000344478 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4516  flavodoxin FldA  44.07 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2230  flavodoxin FldA  44.07 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2191  flavodoxin FldA  44.07 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  unclonable  0.00000416512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  44.07 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000052046  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  44.07 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  43.5 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  43.5 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  44.89 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1910  flavodoxin FldA  43.5 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000190222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  45.45 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  43.5 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  43.75 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  43.89 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  42.61 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  42.61 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  43.5 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  44.32 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  42.7 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  42.94 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  43.02 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  41.24 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  46.02 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  41.9 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  40.8 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0874  flavodoxin  40.68 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  41.71 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  41.71 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  41.14 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  41.48 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  41.01 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2408  flavodoxin FldA  43.53 
 
 		 160 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  41.24 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1356  flavodoxin FldA  39.08 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.267183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  41.14 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  43.79 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  43.02 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4096  flavodoxin FldB  41.71 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  41.48 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3893  flavodoxin FldB  40.68 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.410227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3279  flavodoxin FldB  42.29 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3381  flavodoxin FldB  42.29 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3276  flavodoxin FldB  42.29 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3213  flavodoxin FldB  42.29 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3201  flavodoxin FldB  42.29 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4067  flavodoxin FldB  43.02 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46972  flavodoxin  42.22 
 
 		 324 aa  127  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  41.14 
 
 		 173 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  41.14 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  41.14 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  41.14 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  41.14 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  41.14 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  41.14 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  41.14 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  41.14 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  41.14 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0409  flavodoxin FldA  41.04 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0832  flavodoxin FldA  42.86 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0079  flavodoxin  39.88 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  40 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  38.29 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03642  flavodoxin FldB  40.57 
 
 		 178 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00831725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>