169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14081 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_14081  flavodoxin FldA  100 
 
 
174 aa  357  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13731  flavodoxin FldA  71.1 
 
 
174 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1272  flavodoxin FldA  71.1 
 
 
174 aa  265  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.468155  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13641  flavodoxin FldA  71.1 
 
 
174 aa  265  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13431  flavodoxin FldA  71.1 
 
 
174 aa  264  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173599  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11561  flavodoxin FldA  70.52 
 
 
173 aa  263  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.140927 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0794  flavodoxin FldA  70.59 
 
 
171 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0860679  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16491  flavodoxin FldA  70.59 
 
 
206 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.360226 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1356  flavodoxin FldA  56.98 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.267183 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2007  flavodoxin FldA  53.25 
 
 
169 aa  185  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1584  flavodoxin FldA  52.07 
 
 
169 aa  185  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.914641  hitchhiker  0.00800437 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2583  flavodoxin FldA  50.89 
 
 
171 aa  177  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.285717  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87975  predicted protein  56.3 
 
 
141 aa  149  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313079  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46972  flavodoxin  41.95 
 
 
324 aa  142  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23658  flavodoxin  39.77 
 
 
207 aa  130  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1384  flavodoxin FldA  40.12 
 
 
163 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000670293  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1573  flavodoxin FldA  40.12 
 
 
163 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.698699  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0268  flavodoxin FldA  39.52 
 
 
163 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0409  flavodoxin FldA  38.92 
 
 
163 aa  122  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  34.52 
 
 
164 aa  120  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4096  flavodoxin FldB  40 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  34.3 
 
 
168 aa  117  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  37.29 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  37.57 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  35.88 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  37.93 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  37.58 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  36.16 
 
 
172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  35.26 
 
 
169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  35.88 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  36.21 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  36.72 
 
 
224 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  39.53 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  36.72 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  36.78 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  35.06 
 
 
175 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1996  flavodoxin FldB  36.93 
 
 
198 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  35.63 
 
 
175 aa  111  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  35.63 
 
 
175 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  33.9 
 
 
177 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  34.29 
 
 
175 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  35.06 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  34.48 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  33.9 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  34.57 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0376  flavodoxin FldA  36.97 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000140694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  35.59 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  35.59 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0561  flavodoxin FldB  36.36 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  35.59 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3305  flavodoxin FldB  36.07 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133036  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  36.59 
 
 
162 aa  108  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
215 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
215 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
215 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  33.91 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  33.91 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  33.91 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  33.91 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
176 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
176 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  33.33 
 
 
172 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  33.33 
 
 
172 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  33.33 
 
 
172 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  33.33 
 
 
177 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
209 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
209 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  35.59 
 
 
209 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03642  flavodoxin FldB  36.42 
 
 
178 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00831725  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  32 
 
 
175 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0079  flavodoxin  35.26 
 
 
165 aa  106  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  35.63 
 
 
173 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  35.63 
 
 
173 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  35.63 
 
 
173 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  35.63 
 
 
173 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  35.63 
 
 
173 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  35.63 
 
 
173 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  35.63 
 
 
173 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  35.63 
 
 
173 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  34.48 
 
 
173 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3276  flavodoxin FldB  35.06 
 
 
173 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  33.33 
 
 
174 aa  104  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3213  flavodoxin FldB  35.06 
 
 
173 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  35.06 
 
 
173 aa  104  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3381  flavodoxin FldB  35.06 
 
 
192 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3279  flavodoxin FldB  35.06 
 
 
192 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3201  flavodoxin FldB  35.06 
 
 
192 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  33.72 
 
 
194 aa  103  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  32.18 
 
 
175 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  32.18 
 
 
175 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  33.71 
 
 
171 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4067  flavodoxin FldB  36.36 
 
 
182 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  37.79 
 
 
171 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  35.76 
 
 
178 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  31.03 
 
 
175 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3893  flavodoxin FldB  33.33 
 
 
200 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.410227  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  32.18 
 
 
175 aa  101  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>