182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1207 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  100 
 
 		 175 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  97.71 
 
 		 175 aa  353  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  89.14 
 
 		 175 aa  330  8e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  88.51 
 
 		 175 aa  329  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  85.71 
 
 		 175 aa  321  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  85.71 
 
 		 175 aa  321  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  85.71 
 
 		 175 aa  321  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  85.06 
 
 		 176 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  85.06 
 
 		 176 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  85.06 
 
 		 176 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  85.06 
 
 		 176 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  85.06 
 
 		 176 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  85.06 
 
 		 176 aa  317  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  85.06 
 
 		 176 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  84.57 
 
 		 215 aa  317  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  84.48 
 
 		 176 aa  316  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  84.48 
 
 		 176 aa  316  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  84.57 
 
 		 215 aa  316  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  84.57 
 
 		 215 aa  316  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  84.48 
 
 		 209 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  84.48 
 
 		 209 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  84.48 
 
 		 209 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  82.12 
 
 		 179 aa  308  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  74.57 
 
 		 174 aa  290  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  75.14 
 
 		 175 aa  285  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  73.99 
 
 		 175 aa  278  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  73.41 
 
 		 174 aa  276  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  71.68 
 
 		 175 aa  273  9e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  72.25 
 
 		 175 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1910  flavodoxin FldA  71.68 
 
 		 175 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  72.32 
 
 		 177 aa  271  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  71.84 
 
 		 174 aa  271  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  71.19 
 
 		 177 aa  269  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  70.52 
 
 		 175 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  71.68 
 
 		 175 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  69.94 
 
 		 175 aa  266  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  71.1 
 
 		 175 aa  267  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119946  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  71.1 
 
 		 175 aa  267  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  71.1 
 
 		 175 aa  267  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  71.1 
 
 		 175 aa  266  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2243  flavodoxin FldA  70.52 
 
 		 175 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000503169  decreased coverage  0.0000000000344478 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4516  flavodoxin FldA  70.52 
 
 		 175 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2230  flavodoxin FldA  70.52 
 
 		 175 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2191  flavodoxin FldA  70.52 
 
 		 175 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  unclonable  0.00000416512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  70.52 
 
 		 175 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000052046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  70.52 
 
 		 175 aa  263  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  69.54 
 
 		 176 aa  261  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0874  flavodoxin  67.24 
 
 		 175 aa  258  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  65.9 
 
 		 174 aa  249  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0095  flavodoxin  70.24 
 
 		 176 aa  243  9.999999999999999e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  53.8 
 
 		 171 aa  197  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  52.94 
 
 		 194 aa  185  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  47.37 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  49.11 
 
 		 169 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1996  flavodoxin FldB  46.71 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  45.03 
 
 		 170 aa  161  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  45.51 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  45.83 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  43.98 
 
 		 172 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  44.58 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  44.58 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  44.71 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  43.98 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  44.31 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  44.58 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  45.12 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3893  flavodoxin FldB  43.37 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.410227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  46.33 
 
 		 177 aa  150  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  42.6 
 
 		 173 aa  150  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  45.18 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0860  flavodoxin  44.91 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000640171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  40.96 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  43.37 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  41.57 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  41.57 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  41.57 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  41.57 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  41.57 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  41.57 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  41.57 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  41.57 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  41.57 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3279  flavodoxin FldB  42.17 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3381  flavodoxin FldB  42.17 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3276  flavodoxin FldB  42.17 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3201  flavodoxin FldB  42.17 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3213  flavodoxin FldB  42.17 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4096  flavodoxin FldB  43.21 
 
 		 172 aa  147  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3305  flavodoxin FldB  43.98 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133036  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  43.64 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0561  flavodoxin FldB  43.83 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  42.46 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  46.15 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  45.93 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03642  flavodoxin FldB  40.96 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00831725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2877  flavodoxin  44.05 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.132846 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3186  hypothetical protein  41.34 
 
 		 180 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155637  normal  0.897165 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  42.68 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  40.91 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4067  flavodoxin FldB  39.77 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>