177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1457 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1457  flavodoxin FldA  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  50.84 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  47.75 
 
 		 178 aa  168  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  47.73 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0510  flavodoxin FldA  45.51 
 
 		 176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3186  hypothetical protein  45.98 
 
 		 180 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155637  normal  0.897165 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  39.66 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  37.93 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  40.45 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  40.57 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  35.06 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  40.23 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  38.86 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  37.14 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  37.36 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  36.41 
 
 		 179 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  36.36 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  36.36 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  36.36 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  38.29 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  36.26 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  36.26 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  36.81 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  37.22 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  37.22 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  37.22 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  37.22 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  37.22 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  37.22 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  37.22 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  37.22 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 209 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 209 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 209 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  37.14 
 
 		 215 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  37.14 
 
 		 215 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  37.14 
 
 		 215 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  36.57 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  37.14 
 
 		 175 aa  118  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  35.39 
 
 		 168 aa  118  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4431  flavodoxin  37.78 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  34.86 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  35.63 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  37.14 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2191  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  unclonable  0.00000416512 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  35.59 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2243  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000503169  decreased coverage  0.0000000000344478 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119946  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4516  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2230  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000052046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  37.71 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  35.43 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1910  flavodoxin FldA  36 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000190222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  34.86 
 
 		 194 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2559  flavodoxin  35 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  33.52 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  35.8 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1573  flavodoxin FldA  35.96 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.698699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  34.46 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  35.03 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1384  flavodoxin FldA  35.96 
 
 		 163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000670293  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0268  flavodoxin FldA  35.96 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  34.66 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  33.52 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46972  flavodoxin  32.22 
 
 		 324 aa  108  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  35.43 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  33.33 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  33.71 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  34.29 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0832  flavodoxin FldA  34.68 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  35.87 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  35.36 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0409  flavodoxin FldA  35.39 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  34.48 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1356  flavodoxin FldA  32.95 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.267183 
 
 
-
 
NC_002950  PG1858  flavodoxin FldA  29.89 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0874  flavodoxin  35.43 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  33.33 
 
 		 163 aa  106  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  35.88 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1996  flavodoxin FldB  33.9 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  33.71 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2408  flavodoxin FldA  31.79 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  33.14 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3893  flavodoxin FldB  32.42 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.410227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  32.39 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0561  flavodoxin FldB  31.32 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  30.6 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  32.04 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  32.04 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  32.04 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  31.43 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  32.04 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  32.04 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  32.04 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>