171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0079 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0079  flavodoxin  100 
 
 		 165 aa  333  5e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  46.3 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  45.78 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  41.21 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0379  flavodoxin FldA  45.34 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0076  flavodoxin FldA  41.51 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3173  flavodoxin FldA  41.51 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  42.68 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2408  flavodoxin FldA  42.77 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  41.57 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  43.56 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  48.41 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  41.1 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  44.44 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1356  flavodoxin FldA  40.12 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.267183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0832  flavodoxin FldA  43.12 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  39.05 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  39.05 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  39.05 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  38.46 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  43.71 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  41.32 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  38.1 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  39.88 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  39.88 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  40.99 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  39.29 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  39.29 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  39.29 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  39.29 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  38.1 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  39.29 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  39.29 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  39.29 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  39.29 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  40.25 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  40.49 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  40.96 
 
 		 194 aa  121  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  36.9 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  40.24 
 
 		 224 aa  121  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3893  flavodoxin FldB  35.67 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.410227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3276  flavodoxin FldB  37.87 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3213  flavodoxin FldB  37.87 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3279  flavodoxin FldB  37.87 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3381  flavodoxin FldB  37.87 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3201  flavodoxin FldB  37.87 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  41.67 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3305  flavodoxin FldB  37.87 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133036  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  38.1 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1996  flavodoxin FldB  39.52 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2656  flavodoxin FldA  39.38 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  41.88 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  36.31 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  40.85 
 
 		 172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4431  flavodoxin  37.35 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4096  flavodoxin FldB  37.72 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0561  flavodoxin FldB  38.41 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13731  flavodoxin FldA  36.47 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  37.93 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  39.52 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2877  flavodoxin  38.55 
 
 		 178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.132846 
 
 
-
 
NC_002950  PG1858  flavodoxin FldA  37.11 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  36.97 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  35.26 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1272  flavodoxin FldA  35.29 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.468155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  36.97 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13641  flavodoxin FldA  35.88 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  37.58 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  39.39 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  35.76 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13431  flavodoxin FldA  35.88 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173599  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  36.75 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  39.16 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  39.16 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  36.36 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  39.16 
 
 		 215 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  39.16 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  39.16 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  39.16 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  39.16 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  39.16 
 
 		 215 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  39.16 
 
 		 215 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4067  flavodoxin FldB  34.68 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  34.32 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0510  flavodoxin FldA  36.84 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  39.39 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  36.97 
 
 		 175 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11561  flavodoxin FldA  35.88 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.140927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  34.55 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3186  hypothetical protein  35.88 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155637  normal  0.897165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  38.55 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  38.55 
 
 		 209 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0860  flavodoxin  35.98 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000640171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  38.55 
 
 		 209 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  38.55 
 
 		 209 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  38.18 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  37.58 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  38.55 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  39.41 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  37.58 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>