167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3381 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3279  flavodoxin FldB  100 
 
 
192 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3201  flavodoxin FldB  100 
 
 
192 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3381  flavodoxin FldB  100 
 
 
192 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3276  flavodoxin FldB  100 
 
 
173 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3213  flavodoxin FldB  100 
 
 
173 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.448857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  94.22 
 
 
173 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  94.22 
 
 
173 aa  340  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  94.22 
 
 
173 aa  340  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  94.22 
 
 
173 aa  340  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  94.22 
 
 
173 aa  340  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  94.22 
 
 
173 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  94.22 
 
 
173 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  94.22 
 
 
173 aa  340  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  94.22 
 
 
173 aa  339  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  91.33 
 
 
173 aa  329  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  77.19 
 
 
172 aa  274  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  76.19 
 
 
172 aa  274  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  76.19 
 
 
172 aa  274  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  78.7 
 
 
172 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  75.6 
 
 
172 aa  272  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3893  flavodoxin FldB  67.18 
 
 
200 aa  271  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.410227  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  76.92 
 
 
172 aa  270  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  73.96 
 
 
172 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  59.44 
 
 
224 aa  241  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  63.69 
 
 
172 aa  235  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1996  flavodoxin FldB  58.6 
 
 
198 aa  231  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0561  flavodoxin FldB  63.47 
 
 
172 aa  228  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4096  flavodoxin FldB  58.82 
 
 
172 aa  220  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03642  flavodoxin FldB  56 
 
 
178 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00831725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3305  flavodoxin FldB  61.31 
 
 
172 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133036  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4067  flavodoxin FldB  56.9 
 
 
182 aa  210  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  56.9 
 
 
176 aa  206  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  46.52 
 
 
194 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2877  flavodoxin  46.86 
 
 
178 aa  160  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.132846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  50 
 
 
176 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  47.59 
 
 
170 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  45.24 
 
 
170 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  42.26 
 
 
171 aa  154  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  42.51 
 
 
174 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  41.92 
 
 
176 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  40.8 
 
 
179 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  43.11 
 
 
175 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  42.17 
 
 
175 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  43.64 
 
 
176 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  43.64 
 
 
176 aa  148  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  41.32 
 
 
175 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  43.64 
 
 
176 aa  148  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  42.17 
 
 
175 aa  148  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  43.64 
 
 
176 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  43.64 
 
 
176 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  41.32 
 
 
175 aa  148  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  40.83 
 
 
175 aa  148  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  40.83 
 
 
175 aa  148  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  40.83 
 
 
175 aa  148  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  43.64 
 
 
176 aa  148  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  43.03 
 
 
176 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  43.03 
 
 
176 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  42.77 
 
 
175 aa  148  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  43.37 
 
 
176 aa  148  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  43.64 
 
 
215 aa  148  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  43.64 
 
 
215 aa  148  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  43.64 
 
 
215 aa  147  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  43.03 
 
 
209 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  43.03 
 
 
209 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  43.03 
 
 
209 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  42.17 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  45.4 
 
 
168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  42.01 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  40.48 
 
 
175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  41.18 
 
 
175 aa  144  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  41.32 
 
 
174 aa  143  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  41.18 
 
 
169 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  40.72 
 
 
175 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  40.12 
 
 
175 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119946  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  40.12 
 
 
175 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  40.12 
 
 
175 aa  141  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  44.44 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  40.12 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  39.52 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  40.24 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1910  flavodoxin FldA  40.12 
 
 
175 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000190222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  42.68 
 
 
168 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  39.05 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2243  flavodoxin FldA  39.52 
 
 
175 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000503169  decreased coverage  0.0000000000344478 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4516  flavodoxin FldA  39.52 
 
 
175 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2230  flavodoxin FldA  39.52 
 
 
175 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  39.52 
 
 
175 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000052046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2191  flavodoxin FldA  39.52 
 
 
175 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  unclonable  0.00000416512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  38.92 
 
 
175 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  41.98 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  44.71 
 
 
171 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0874  flavodoxin  37.87 
 
 
175 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  42.86 
 
 
168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  39.16 
 
 
174 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  42.29 
 
 
177 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  41.72 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  41.98 
 
 
162 aa  123  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  41.1 
 
 
174 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  40.78 
 
 
180 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1356  flavodoxin FldA  38.29 
 
 
174 aa  120  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.267183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>