190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0376 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0376  flavodoxin FldA  100 
 
 
163 aa  328  1e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000140694  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  84.05 
 
 
163 aa  284  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  68.71 
 
 
162 aa  226  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1573  flavodoxin FldA  67.9 
 
 
163 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.698699  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1384  flavodoxin FldA  67.28 
 
 
163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000670293  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0268  flavodoxin FldA  67.9 
 
 
163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0409  flavodoxin FldA  67.9 
 
 
163 aa  218  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  57.86 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  48.77 
 
 
168 aa  147  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  44.72 
 
 
168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  48.77 
 
 
168 aa  142  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  45.12 
 
 
168 aa  141  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  46.58 
 
 
164 aa  140  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  47.56 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0860  flavodoxin  39.75 
 
 
169 aa  130  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000640171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0076  flavodoxin FldA  41.36 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  43.45 
 
 
174 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  38.89 
 
 
170 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  40 
 
 
170 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  40.96 
 
 
194 aa  121  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  39.88 
 
 
180 aa  121  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  41.67 
 
 
176 aa  120  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1858  flavodoxin FldA  42.41 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3173  flavodoxin FldA  40.74 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  37.65 
 
 
178 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  38.04 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  40.12 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  38.27 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  41.25 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2559  flavodoxin  39.31 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  39.13 
 
 
175 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  39.13 
 
 
175 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  39.13 
 
 
175 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  37.35 
 
 
169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0379  flavodoxin FldA  41.77 
 
 
160 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2408  flavodoxin FldA  39.62 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  39.26 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03642  flavodoxin FldB  39.76 
 
 
178 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00831725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  35.76 
 
 
177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0561  flavodoxin FldB  40.12 
 
 
172 aa  111  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  36.97 
 
 
171 aa  111  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  36.81 
 
 
175 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4431  flavodoxin  37.93 
 
 
175 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  37.42 
 
 
175 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  35.98 
 
 
175 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14081  flavodoxin FldA  36.97 
 
 
174 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  35.15 
 
 
177 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23658  flavodoxin  39.39 
 
 
207 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  35.98 
 
 
174 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  39.88 
 
 
171 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  36.65 
 
 
175 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  37.2 
 
 
174 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1584  flavodoxin FldA  41.1 
 
 
169 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.914641  hitchhiker  0.00800437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  37.27 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  37.65 
 
 
172 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  36.42 
 
 
175 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  35.8 
 
 
175 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2007  flavodoxin FldA  40.49 
 
 
169 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13731  flavodoxin FldA  36.36 
 
 
174 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0510  flavodoxin FldA  35.29 
 
 
176 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  36.36 
 
 
224 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  37.58 
 
 
172 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  37.04 
 
 
172 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  38.18 
 
 
172 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  36.47 
 
 
177 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4067  flavodoxin FldB  36.75 
 
 
182 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  36.65 
 
 
175 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119946  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  36.65 
 
 
175 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  36.65 
 
 
175 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  36.65 
 
 
175 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  36.75 
 
 
179 aa  104  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  35.37 
 
 
174 aa  104  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  37.04 
 
 
172 aa  104  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  34.97 
 
 
215 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  34.57 
 
 
175 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  34.97 
 
 
215 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  37.04 
 
 
172 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  36.02 
 
 
175 aa  103  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13641  flavodoxin FldA  36.36 
 
 
174 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  34.97 
 
 
215 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  35.37 
 
 
176 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  33.95 
 
 
176 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2656  flavodoxin FldA  37.65 
 
 
160 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  33.95 
 
 
176 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  33.95 
 
 
176 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  37.58 
 
 
172 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  37.58 
 
 
172 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  33.95 
 
 
176 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  33.95 
 
 
176 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13431  flavodoxin FldA  36.36 
 
 
174 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  33.95 
 
 
176 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2191  flavodoxin FldA  36.02 
 
 
175 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  unclonable  0.00000416512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  34.36 
 
 
209 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  34.36 
 
 
209 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11561  flavodoxin FldA  37.58 
 
 
173 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.140927 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0095  flavodoxin  36.81 
 
 
176 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4516  flavodoxin FldA  36.02 
 
 
175 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2230  flavodoxin FldA  36.02 
 
 
175 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  34.36 
 
 
209 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  36.02 
 
 
175 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000052046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>