238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1064 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0963  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
58 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1064  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
58 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10681  30S ribosomal protein S21  81.03 
 
 
58 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0404738  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0993  30S ribosomal protein S21  79.31 
 
 
58 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.149437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10681  30S ribosomal protein S21  79.31 
 
 
58 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10661  30S ribosomal protein S21  79.31 
 
 
58 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10611  30S ribosomal protein S21  86.27 
 
 
58 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1060  30S ribosomal protein S21  84.31 
 
 
58 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11801  30S ribosomal protein S21  84.31 
 
 
58 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.216107 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19351  30S ribosomal protein S21  84.31 
 
 
58 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.564585  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00751  30S ribosomal protein S21  75 
 
 
56 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.17541  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4662  30S ribosomal protein S21  68.42 
 
 
64 aa  79.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1119  30S ribosomal protein S21  67.24 
 
 
61 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0978  30S ribosomal protein S21  64.91 
 
 
61 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0783666 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0951  30S ribosomal protein S21  64.91 
 
 
61 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  62.07 
 
 
62 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4643  30S ribosomal protein S21  72.92 
 
 
62 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0890115  normal  0.0585031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1344  30S ribosomal protein S21  70.83 
 
 
59 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  63.16 
 
 
58 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  61.4 
 
 
58 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4533  ribosomal protein S21  64.58 
 
 
62 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.309152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2872  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 
60 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.731741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3249  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 
60 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4131  30S ribosomal protein S21  62.79 
 
 
60 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
57 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  48.28 
 
 
58 aa  57.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0665  ribosomal protein S21  58.54 
 
 
41 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  44.83 
 
 
57 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
61 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0497  SSU ribosomal protein S21P  55.32 
 
 
50 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.901417  normal  0.599085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 
58 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  56.25 
 
 
58 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 
58 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 
58 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
58 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  53.66 
 
 
58 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  54.17 
 
 
57 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  50 
 
 
59 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  56.25 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  58.54 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  51.22 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  47.92 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  54.17 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  54.17 
 
 
58 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
58 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1781  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.966323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  50 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  47.92 
 
 
59 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0396  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  54.17 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  47.92 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  43.1 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1573  30S ribosomal protein S21  55.26 
 
 
58 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000232116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0660  30S ribosomal protein S21  54.76 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186503  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  55.32 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  55.32 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  55.32 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  50 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1974  30S ribosomal protein S21  52.27 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118176  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  50 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  48.98 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2340  30S ribosomal protein S21  52.27 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221975  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8802  predicted protein  53.06 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  44.9 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  54.17 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  54.17 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
71 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
71 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 
65 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
70 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
58 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
58 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  52.08 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  43.9 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 
70 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
58 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  51.06 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  44.83 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
58 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  47.92 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
57 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
57 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  44.9 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  43.75 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>