275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1573 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1573  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
58 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000232116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  82.14 
 
 
58 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  77.59 
 
 
59 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  75.44 
 
 
59 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 
58 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  73.21 
 
 
58 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  80 
 
 
65 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  71.43 
 
 
61 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  69.64 
 
 
58 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  70.18 
 
 
58 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  73.21 
 
 
58 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  75 
 
 
58 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
58 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
58 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  68.97 
 
 
58 aa  83.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  70.69 
 
 
58 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  68.97 
 
 
58 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  59.65 
 
 
60 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
58 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
58 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
57 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
58 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  56.14 
 
 
58 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
57 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  54.39 
 
 
57 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  59.65 
 
 
60 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  53.45 
 
 
58 aa  72  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  51.72 
 
 
58 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  60 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
57 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  68.09 
 
 
56 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  60.38 
 
 
57 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1344  30S ribosomal protein S21  51.72 
 
 
59 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  65.38 
 
 
63 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  54.55 
 
 
71 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
65 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 
71 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  56.36 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  54.39 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  54.39 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  60 
 
 
61 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  48.21 
 
 
71 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 
71 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  53.57 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4643  30S ribosomal protein S21  51.67 
 
 
62 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0890115  normal  0.0585031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  53.57 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0660  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  50.91 
 
 
70 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  47.27 
 
 
77 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4662  30S ribosomal protein S21  49.12 
 
 
64 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  54.39 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0978  30S ribosomal protein S21  47.37 
 
 
61 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0783666 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0951  30S ribosomal protein S21  47.37 
 
 
61 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  58.14 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>