52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3208 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1468  hypothetical protein  56.32 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000729237  decreased coverage  0.0000188796 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2602  hypothetical protein  53.76 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000348759  hitchhiker  0.000000414333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2669  hypothetical protein  53.23 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0126952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2776  hypothetical protein  52.69 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  decreased coverage  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06493  hypothetical protein  52.35 
 
 		 180 aa  187  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1391  hypothetical protein  53.19 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003277  hypothetical protein  50.57 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.921739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2862  protein of unknown function DUF925  51.02 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0358865  unclonable  0.00000000000145139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1520  hypothetical protein  48.56 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00822925  normal  0.544828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1484  hypothetical protein  49.01 
 
 		 229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0297404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1489  hypothetical protein  49.5 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1672  hypothetical protein  51.08 
 
 		 195 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2789  hypothetical protein  47.51 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0745609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1333  hypothetical protein  48.04 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00042166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2590  hypothetical protein  44.68 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00160082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1324  hypothetical protein  42.49 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000375255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1435  hypothetical protein  42.49 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000858133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2741  hypothetical protein  42.49 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000501753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0420  hypothetical protein  42.39 
 
 		 184 aa  144  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  45.98 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3437  hypothetical protein  49.09 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1370  hypothetical protein  43.82 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.777318  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2750  hypothetical protein  43.75 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5499  hypothetical protein  42.69 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2043  hypothetical protein  39.78 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03666  hypothetical protein  38.07 
 
 		 209 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3542  hypothetical protein  39.41 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2001  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2248  hypothetical protein  37.91 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2330  hypothetical protein  37.36 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000027236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2002  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3125  hypothetical protein  35.16 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2200  hypothetical protein  35.71 
 
 		 191 aa  121  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.443855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2246  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02919e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2218  hypothetical protein  34.07 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.177664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2062  hypothetical protein  34.07 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  36.09 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  36.09 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  36.69 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0597  hypothetical protein  33.53 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0089  hypothetical protein  32.14 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4474  hypothetical protein  35.67 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1341  hypothetical protein  46.46 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267893  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  29.32 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  27.03 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1188  hypothetical protein  27.42 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0133  hypothetical protein  29.19 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0822  hypothetical protein  24.57 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0692  hypothetical protein  27.06 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1791  hypothetical protein  26.82 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>