49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2602 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2602  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000348759  hitchhiker  0.000000414333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2669  hypothetical protein  98.97 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0126952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2776  hypothetical protein  88.72 
 
 
195 aa  358  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  decreased coverage  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1672  hypothetical protein  75.77 
 
 
195 aa  293  9e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1391  hypothetical protein  64.14 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1520  hypothetical protein  56.74 
 
 
235 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00822925  normal  0.544828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1484  hypothetical protein  57.42 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0297404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2862  protein of unknown function DUF925  58.62 
 
 
223 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0358865  unclonable  0.00000000000145139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1489  hypothetical protein  56.94 
 
 
229 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  53.76 
 
 
189 aa  193  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1468  hypothetical protein  50.79 
 
 
197 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000729237  decreased coverage  0.0000188796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2789  hypothetical protein  51.34 
 
 
197 aa  177  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0745609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1333  hypothetical protein  48.04 
 
 
200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00042166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2590  hypothetical protein  45.55 
 
 
201 aa  167  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00160082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06493  hypothetical protein  47.18 
 
 
180 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3437  hypothetical protein  49.72 
 
 
182 aa  158  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1324  hypothetical protein  46.5 
 
 
201 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000375255  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2741  hypothetical protein  46.5 
 
 
201 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000501753  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1435  hypothetical protein  46.5 
 
 
201 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000858133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003277  hypothetical protein  43.96 
 
 
208 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.921739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  44.02 
 
 
181 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1370  hypothetical protein  43.16 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.777318  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2750  hypothetical protein  44.17 
 
 
171 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5499  hypothetical protein  43.31 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3542  hypothetical protein  38.86 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0420  hypothetical protein  39.63 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03666  hypothetical protein  34.56 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  39.02 
 
 
179 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2200  hypothetical protein  33.69 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.443855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3125  hypothetical protein  33.69 
 
 
191 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2248  hypothetical protein  35.29 
 
 
220 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2002  hypothetical protein  34.88 
 
 
191 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2001  hypothetical protein  34.88 
 
 
191 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2246  hypothetical protein  34.88 
 
 
191 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02919e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2043  hypothetical protein  33.69 
 
 
191 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2218  hypothetical protein  34.3 
 
 
191 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.177664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2330  hypothetical protein  33.69 
 
 
189 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000027236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2062  hypothetical protein  34.3 
 
 
191 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  34.09 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  34.09 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1341  hypothetical protein  36.7 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267893  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0089  hypothetical protein  27.95 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517248  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0597  hypothetical protein  26.54 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  25.56 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  26.11 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  26.24 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1188  hypothetical protein  22.94 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4474  hypothetical protein  30.43 
 
 
198 aa  44.7  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359543  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0133  hypothetical protein  28.28 
 
 
204 aa  44.7  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>