48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1333 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1333  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00042166  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2669  hypothetical protein  48.94 
 
 		 195 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0126952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2602  hypothetical protein  47.87 
 
 		 195 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000348759  hitchhiker  0.000000414333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2862  protein of unknown function DUF925  45.79 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0358865  unclonable  0.00000000000145139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2776  hypothetical protein  46.28 
 
 		 195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  decreased coverage  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2789  hypothetical protein  48.65 
 
 		 197 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0745609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1391  hypothetical protein  46.94 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1484  hypothetical protein  42.86 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0297404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  47.54 
 
 		 189 aa  164  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1489  hypothetical protein  43.37 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1520  hypothetical protein  41.58 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00822925  normal  0.544828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1672  hypothetical protein  46.7 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2590  hypothetical protein  45.21 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00160082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1468  hypothetical protein  48.45 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000729237  decreased coverage  0.0000188796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1370  hypothetical protein  39.77 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.777318  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3437  hypothetical protein  43.71 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2741  hypothetical protein  39.3 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000501753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1324  hypothetical protein  39.3 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000375255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1435  hypothetical protein  39.3 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000858133  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06493  hypothetical protein  40.64 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003277  hypothetical protein  39.23 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.921739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  40.7 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2750  hypothetical protein  39.02 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5499  hypothetical protein  37.72 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0420  hypothetical protein  34.24 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3542  hypothetical protein  36.97 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03666  hypothetical protein  32.98 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2043  hypothetical protein  36.14 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2062  hypothetical protein  32.28 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2218  hypothetical protein  32.28 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.177664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2002  hypothetical protein  32.28 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2200  hypothetical protein  34.15 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.443855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2248  hypothetical protein  34.94 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2246  hypothetical protein  32.28 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02919e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2001  hypothetical protein  31.72 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3125  hypothetical protein  32.32 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2330  hypothetical protein  33.13 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000027236  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  30.68 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  30.68 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0597  hypothetical protein  32.78 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  32.4 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0089  hypothetical protein  26.97 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  30.34 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  31.85 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1341  hypothetical protein  42.11 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267893  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4474  hypothetical protein  27.88 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  30.66 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1188  hypothetical protein  22.81 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>