47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1484 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1484  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0297404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1489  hypothetical protein  95.2 
 
 
229 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2862  protein of unknown function DUF925  90.83 
 
 
223 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0358865  unclonable  0.00000000000145139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1520  hypothetical protein  91.06 
 
 
235 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00822925  normal  0.544828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1391  hypothetical protein  66.99 
 
 
217 aa  288  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2776  hypothetical protein  58.17 
 
 
195 aa  244  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  decreased coverage  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2602  hypothetical protein  57.42 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000348759  hitchhiker  0.000000414333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2669  hypothetical protein  57.42 
 
 
195 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0126952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1672  hypothetical protein  58.45 
 
 
195 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  49.01 
 
 
189 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1468  hypothetical protein  46.34 
 
 
197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000729237  decreased coverage  0.0000188796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2789  hypothetical protein  46.43 
 
 
197 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0745609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2590  hypothetical protein  42.79 
 
 
201 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00160082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1333  hypothetical protein  42.71 
 
 
200 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00042166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1435  hypothetical protein  39.91 
 
 
201 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000858133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1324  hypothetical protein  39.91 
 
 
201 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000375255  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06493  hypothetical protein  40.29 
 
 
180 aa  148  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2741  hypothetical protein  39.91 
 
 
201 aa  148  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000501753  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003277  hypothetical protein  40.57 
 
 
208 aa  148  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.921739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3437  hypothetical protein  43.01 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  41.83 
 
 
181 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1370  hypothetical protein  37.38 
 
 
195 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.777318  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5499  hypothetical protein  38.64 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0420  hypothetical protein  36.06 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2750  hypothetical protein  35.96 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3542  hypothetical protein  38.37 
 
 
199 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2248  hypothetical protein  32.97 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  34.04 
 
 
188 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  34.04 
 
 
188 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03666  hypothetical protein  32.2 
 
 
209 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2200  hypothetical protein  32.43 
 
 
191 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.443855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2002  hypothetical protein  31.35 
 
 
191 aa  101  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3125  hypothetical protein  31.89 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2043  hypothetical protein  30.81 
 
 
191 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2001  hypothetical protein  31.89 
 
 
191 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2246  hypothetical protein  31.35 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02919e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2330  hypothetical protein  31.35 
 
 
189 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000027236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2218  hypothetical protein  30.81 
 
 
191 aa  98.6  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.177664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2062  hypothetical protein  30.81 
 
 
191 aa  98.6  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  33.68 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0597  hypothetical protein  31.03 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  27.04 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1341  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267893  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0089  hypothetical protein  28.81 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  22.63 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4474  hypothetical protein  28.31 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359543  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  27.67 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>