48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2789 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2789  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0745609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2602  hypothetical protein  51.34 
 
 
195 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000348759  hitchhiker  0.000000414333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2669  hypothetical protein  50.8 
 
 
195 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0126952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2862  protein of unknown function DUF925  46.97 
 
 
223 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0358865  unclonable  0.00000000000145139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1468  hypothetical protein  46.03 
 
 
197 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000729237  decreased coverage  0.0000188796 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2776  hypothetical protein  50.27 
 
 
195 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  decreased coverage  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1520  hypothetical protein  45.27 
 
 
235 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00822925  normal  0.544828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1489  hypothetical protein  47.45 
 
 
229 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1484  hypothetical protein  46.43 
 
 
229 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0297404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1333  hypothetical protein  48.33 
 
 
200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00042166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1391  hypothetical protein  47.64 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  47.51 
 
 
189 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1672  hypothetical protein  46.39 
 
 
195 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2741  hypothetical protein  42.79 
 
 
201 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000501753  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1435  hypothetical protein  42.79 
 
 
201 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000858133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1324  hypothetical protein  42.79 
 
 
201 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000375255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3437  hypothetical protein  48.04 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  42.78 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2590  hypothetical protein  40.2 
 
 
201 aa  141  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00160082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06493  hypothetical protein  41.27 
 
 
180 aa  141  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003277  hypothetical protein  40.78 
 
 
208 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.921739  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0420  hypothetical protein  37.37 
 
 
184 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2001  hypothetical protein  32.16 
 
 
191 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2002  hypothetical protein  32.16 
 
 
191 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2248  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2062  hypothetical protein  32.16 
 
 
191 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2218  hypothetical protein  32.16 
 
 
191 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.177664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2200  hypothetical protein  32.16 
 
 
191 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.443855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2246  hypothetical protein  32.16 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02919e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3125  hypothetical protein  32.66 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03666  hypothetical protein  34.47 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2750  hypothetical protein  36.31 
 
 
171 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2043  hypothetical protein  32.34 
 
 
191 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1370  hypothetical protein  35.36 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.777318  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3542  hypothetical protein  37.16 
 
 
199 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2330  hypothetical protein  31.66 
 
 
189 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000027236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5499  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47391  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0597  hypothetical protein  31.31 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  30.6 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0089  hypothetical protein  31.46 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  25.97 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1341  hypothetical protein  38.1 
 
 
119 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267893  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  31.33 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1188  hypothetical protein  24.42 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  25.29 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0133  hypothetical protein  27.67 
 
 
204 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>