46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1520 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1520  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  493  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00822925  normal  0.544828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1484  hypothetical protein  91.06 
 
 
229 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0297404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1489  hypothetical protein  91.06 
 
 
229 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2862  protein of unknown function DUF925  88.94 
 
 
223 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0358865  unclonable  0.00000000000145139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1391  hypothetical protein  65.28 
 
 
217 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2602  hypothetical protein  56.74 
 
 
195 aa  244  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000348759  hitchhiker  0.000000414333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2669  hypothetical protein  56.74 
 
 
195 aa  244  8e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0126952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2776  hypothetical protein  56.54 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  decreased coverage  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1672  hypothetical protein  58.69 
 
 
195 aa  241  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  48.56 
 
 
189 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1468  hypothetical protein  45.75 
 
 
197 aa  184  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000729237  decreased coverage  0.0000188796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2789  hypothetical protein  45.77 
 
 
197 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0745609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2590  hypothetical protein  40.65 
 
 
201 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00160082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1333  hypothetical protein  41.41 
 
 
200 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00042166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2741  hypothetical protein  39.74 
 
 
201 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000501753  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1324  hypothetical protein  39.74 
 
 
201 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000375255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1435  hypothetical protein  39.74 
 
 
201 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000858133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003277  hypothetical protein  39.27 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.921739  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06493  hypothetical protein  38.21 
 
 
180 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3437  hypothetical protein  41.67 
 
 
182 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  39.72 
 
 
181 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1370  hypothetical protein  34.91 
 
 
195 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.777318  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0420  hypothetical protein  34.48 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3542  hypothetical protein  37.64 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5499  hypothetical protein  36.26 
 
 
188 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2750  hypothetical protein  35.33 
 
 
171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03666  hypothetical protein  31.75 
 
 
209 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2248  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  32.99 
 
 
188 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  32.99 
 
 
188 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2002  hypothetical protein  30.88 
 
 
191 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2001  hypothetical protein  31.41 
 
 
191 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2200  hypothetical protein  31.41 
 
 
191 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.443855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2043  hypothetical protein  30.89 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2246  hypothetical protein  30.88 
 
 
191 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02919e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3125  hypothetical protein  30.89 
 
 
191 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2218  hypothetical protein  30.39 
 
 
191 aa  98.6  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.177664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2062  hypothetical protein  30.39 
 
 
191 aa  98.6  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2330  hypothetical protein  30.65 
 
 
189 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000027236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  32.66 
 
 
179 aa  91.7  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0597  hypothetical protein  29.44 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1341  hypothetical protein  45.83 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267893  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0089  hypothetical protein  38.04 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  24.31 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  23.47 
 
 
199 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  27.67 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>