51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003277 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003277  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.921739  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06493  hypothetical protein  64.2 
 
 
180 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  50.57 
 
 
189 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  46.59 
 
 
181 aa  157  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1468  hypothetical protein  46.15 
 
 
197 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000729237  decreased coverage  0.0000188796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1324  hypothetical protein  42.78 
 
 
201 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000375255  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2741  hypothetical protein  42.78 
 
 
201 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000501753  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1435  hypothetical protein  42.78 
 
 
201 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000858133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2776  hypothetical protein  43.62 
 
 
195 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  decreased coverage  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2862  protein of unknown function DUF925  43.08 
 
 
223 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0358865  unclonable  0.00000000000145139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2602  hypothetical protein  43.96 
 
 
195 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000348759  hitchhiker  0.000000414333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1484  hypothetical protein  40.57 
 
 
229 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0297404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3437  hypothetical protein  46.99 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2669  hypothetical protein  43.41 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0126952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1520  hypothetical protein  39.27 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00822925  normal  0.544828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1489  hypothetical protein  42.5 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03666  hypothetical protein  39.7 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1672  hypothetical protein  46.45 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1391  hypothetical protein  42.86 
 
 
217 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2590  hypothetical protein  41.76 
 
 
201 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00160082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2789  hypothetical protein  40.78 
 
 
197 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0745609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0420  hypothetical protein  39.89 
 
 
184 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5499  hypothetical protein  40.68 
 
 
188 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1370  hypothetical protein  40.56 
 
 
195 aa  131  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.777318  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2750  hypothetical protein  42.68 
 
 
171 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1333  hypothetical protein  39.33 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00042166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3542  hypothetical protein  36.42 
 
 
199 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2248  hypothetical protein  35.75 
 
 
220 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2043  hypothetical protein  35.16 
 
 
191 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2330  hypothetical protein  34.64 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000027236  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  33.52 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  33.52 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2002  hypothetical protein  34.08 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2246  hypothetical protein  33.52 
 
 
191 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02919e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2001  hypothetical protein  33.52 
 
 
191 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2218  hypothetical protein  33.52 
 
 
191 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.177664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2062  hypothetical protein  33.52 
 
 
191 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3125  hypothetical protein  32.96 
 
 
191 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2200  hypothetical protein  32.96 
 
 
191 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.443855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0597  hypothetical protein  33.51 
 
 
187 aa  99.4  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  36.53 
 
 
179 aa  98.6  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0089  hypothetical protein  33.52 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517248  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1341  hypothetical protein  47.42 
 
 
119 aa  84.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267893  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  26.15 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4474  hypothetical protein  27.23 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359543  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1188  hypothetical protein  24.6 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  25.26 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0133  hypothetical protein  27.78 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  25.51 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0822  hypothetical protein  25.14 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0692  hypothetical protein  25.58 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>