35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0692 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0692  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  390  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0822  hypothetical protein  55.61 
 
 
189 aa  217  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1791  hypothetical protein  40.86 
 
 
186 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4474  hypothetical protein  42.78 
 
 
198 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359543  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  46.25 
 
 
215 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  38.36 
 
 
199 aa  117  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  28.89 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1188  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  99  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0133  hypothetical protein  35.26 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  32.7 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  32.7 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2200  hypothetical protein  25.53 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.443855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2330  hypothetical protein  26.6 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000027236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2043  hypothetical protein  23.94 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2001  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2246  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02919e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2002  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3125  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  30.92 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2248  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2218  hypothetical protein  24.47 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.177664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2062  hypothetical protein  24.47 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3542  hypothetical protein  26.7 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0089  hypothetical protein  25.93 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0420  hypothetical protein  29.48 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2750  hypothetical protein  26.83 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5499  hypothetical protein  25.68 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  27.06 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0597  hypothetical protein  20.74 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003277  hypothetical protein  25.58 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.921739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3437  hypothetical protein  25.43 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06493  hypothetical protein  20.63 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  25.81 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2590  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00160082  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1341  hypothetical protein  30.99 
 
 
119 aa  41.6  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267893  normal  0.175308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>