More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0571 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0571  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  100 
 
 
293 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646781  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0263  hypothetical protein  65.25 
 
 
286 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0604061  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2084  hypothetical protein  59.19 
 
 
278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3013  hypothetical protein  51.76 
 
 
300 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3544  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.21 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3585  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.26 
 
 
291 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0326  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.91 
 
 
318 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4011  hypothetical protein  50.72 
 
 
303 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.301912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3693  hypothetical protein  52.26 
 
 
307 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.929135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4593  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.61 
 
 
305 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0315173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  51.81 
 
 
306 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0321  hypothetical protein  46.49 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4330  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.07 
 
 
305 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0025  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  52.5 
 
 
317 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0421  hypothetical protein  50.18 
 
 
324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0399  hypothetical protein  50.55 
 
 
317 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3497  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.97 
 
 
306 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0340  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.17 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124929  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0022  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.69 
 
 
347 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0674688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0182  putative methyltransferase  50.18 
 
 
297 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0147  hypothetical protein  48.54 
 
 
314 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.45 
 
 
278 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0174  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3117  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.82 
 
 
339 aa  222  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0177  tetrapyrrole methylase family protein  48.38 
 
 
285 aa  222  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0897585  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0171  tetrapyrrole methylase family protein  48.38 
 
 
285 aa  222  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.57 
 
 
276 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1813  hypothetical protein  47.12 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.93 
 
 
276 aa  218  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0292  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.64 
 
 
329 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0460  Fis family transcriptional regulator  47.12 
 
 
295 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0115  hypothetical protein  46.69 
 
 
317 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  46.32 
 
 
281 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.42 
 
 
282 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  45.45 
 
 
281 aa  215  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0471  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.68 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.28 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  44.91 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  43.12 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.65 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1533  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.92 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.235566  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.2 
 
 
280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1043  tetrapyrrole methylase family protein  44.37 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.210407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  46.47 
 
 
281 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  46.1 
 
 
281 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0448  hypothetical protein  47.5 
 
 
287 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149226  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  46.1 
 
 
281 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  44.16 
 
 
287 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0653  tetrapyrrole methylase family protein  43.88 
 
 
286 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0748907  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0405  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.35 
 
 
316 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2831  hypothetical protein  46.79 
 
 
284 aa  208  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  45.26 
 
 
288 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.09 
 
 
280 aa  208  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.44 
 
 
280 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.01 
 
 
273 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.44 
 
 
280 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.91 
 
 
282 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  46.64 
 
 
273 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.44 
 
 
280 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2462  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.82 
 
 
287 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.44 
 
 
280 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.19 
 
 
272 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  42.91 
 
 
282 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  45.26 
 
 
281 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0899  hypothetical protein  43.17 
 
 
285 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.07 
 
 
280 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0496  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.88 
 
 
309 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.792442  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  46.13 
 
 
286 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12801  putative tetrapyrrole methylase family protein  39.13 
 
 
306 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.105851  normal  0.0426516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.93 
 
 
316 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0355005  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.94 
 
 
291 aa  202  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0473  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.57 
 
 
316 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2939  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.74 
 
 
323 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  45.25 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.67 
 
 
280 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  42.7 
 
 
287 aa  198  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  44.44 
 
 
292 aa  198  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.27 
 
 
295 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  45.27 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3910  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.61 
 
 
281 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  45.93 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3919  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.36 
 
 
297 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0903297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1545  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.73 
 
 
284 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338638 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  45.76 
 
 
286 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.76 
 
 
286 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  45.39 
 
 
286 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  41.91 
 
 
280 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  45.32 
 
 
304 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  45.76 
 
 
286 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20320  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  39.35 
 
 
286 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028573  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  42.28 
 
 
280 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  45.32 
 
 
286 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  45.76 
 
 
286 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  45.76 
 
 
287 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.39 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  45.39 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  45.39 
 
 
287 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0163  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  39.05 
 
 
282 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000433503  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  45.39 
 
 
287 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  45.39 
 
 
287 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>