More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4011 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_4011  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.301912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3544  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.74 
 
 
320 aa  346  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.54 
 
 
303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4330  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  59.09 
 
 
305 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0177  tetrapyrrole methylase family protein  65.6 
 
 
285 aa  329  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0897585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4593  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  58.69 
 
 
305 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0315173 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0171  tetrapyrrole methylase family protein  65.6 
 
 
285 aa  329  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  59.31 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1043  tetrapyrrole methylase family protein  51.17 
 
 
301 aa  294  1e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.210407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0340  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  57.44 
 
 
320 aa  291  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124929  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0326  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.34 
 
 
318 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3497  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.38 
 
 
306 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0025  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  55.32 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0321  hypothetical protein  48.99 
 
 
317 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3013  hypothetical protein  53.24 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0022  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.76 
 
 
347 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0674688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3585  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  55.07 
 
 
291 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3693  hypothetical protein  58.11 
 
 
307 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.929135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.99 
 
 
287 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2084  hypothetical protein  52.19 
 
 
278 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0399  hypothetical protein  48.2 
 
 
317 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0405  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.7 
 
 
316 aa  245  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2939  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  59.32 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0421  hypothetical protein  50.17 
 
 
324 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0496  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.46 
 
 
309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.792442  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0147  hypothetical protein  48.96 
 
 
314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  57.45 
 
 
316 aa  242  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0355005  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1813  hypothetical protein  52.14 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0571  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.72 
 
 
293 aa  241  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646781  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0460  Fis family transcriptional regulator  52.14 
 
 
295 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  46.15 
 
 
285 aa  238  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0473  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  56.17 
 
 
316 aa  238  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2831  hypothetical protein  49.47 
 
 
284 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.32 
 
 
278 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  47.64 
 
 
286 aa  235  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.38 
 
 
282 aa  235  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0471  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.36 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.12 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  48.9 
 
 
281 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  45.49 
 
 
282 aa  232  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  46.21 
 
 
288 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0115  hypothetical protein  51.85 
 
 
317 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0182  putative methyltransferase  54.01 
 
 
297 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  47.99 
 
 
287 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  48 
 
 
286 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  47.99 
 
 
287 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.35 
 
 
276 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  47.99 
 
 
287 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  47.83 
 
 
287 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  48 
 
 
286 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48 
 
 
286 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  48 
 
 
286 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  47.54 
 
 
293 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  48 
 
 
286 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  47.99 
 
 
287 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.22 
 
 
291 aa  229  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.64 
 
 
286 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.63 
 
 
299 aa  228  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  47.78 
 
 
304 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.39 
 
 
289 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.39 
 
 
289 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0653  tetrapyrrole methylase family protein  51.06 
 
 
286 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0748907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  47.27 
 
 
286 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.59 
 
 
282 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  48.91 
 
 
281 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  47.27 
 
 
299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  47.27 
 
 
299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.27 
 
 
299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0292  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.3 
 
 
329 aa  225  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.76 
 
 
280 aa  225  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.95 
 
 
295 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2393  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.59 
 
 
293 aa  225  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957737  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  44.73 
 
 
287 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.06 
 
 
272 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  45.69 
 
 
287 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1105  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.29 
 
 
279 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0035  hypothetical protein  44.8 
 
 
287 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0515864  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0240  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  55.41 
 
 
246 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  44.32 
 
 
291 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0448  hypothetical protein  48.38 
 
 
287 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149226  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  46.15 
 
 
280 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  45.74 
 
 
289 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  50.18 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0046  methyltransferases  43.01 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000692079  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  47.17 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.17 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  46.5 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0063  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.83 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000661848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  49.43 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  48.35 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  46.47 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  50.18 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1602  hypothetical protein  42.7 
 
 
279 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00301963  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.42 
 
 
292 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0951  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.5 
 
 
321 aa  219  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  0.342513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  44.69 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.55 
 
 
288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  45.05 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  43.12 
 
 
281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3919  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.07 
 
 
297 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0903297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>