More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3481 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  100 
 
 
276 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  97.46 
 
 
276 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  69.93 
 
 
282 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2861  hypothetical protein  66.42 
 
 
282 aa  352  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189341  hitchhiker  0.000000116322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  59.78 
 
 
282 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0653  tetrapyrrole methylase family protein  59.78 
 
 
286 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0748907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  60.65 
 
 
278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0060  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.31 
 
 
273 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000025326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2215  putative tetrapyrrole methylase family protein  52.73 
 
 
285 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0031  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.82 
 
 
290 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0041  tetrapyrrole methylase family protein  46.86 
 
 
291 aa  265  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5275  tetrapyrrole methylase family protein  47.06 
 
 
291 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  50.36 
 
 
285 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0034  hypothetical protein  47.06 
 
 
291 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0063  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.36 
 
 
286 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000661848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.1 
 
 
289 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.1 
 
 
289 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0031  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.13 
 
 
291 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0045  tetrapyrrole methylase family protein  46.86 
 
 
291 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0035  hypothetical protein  46.69 
 
 
291 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0032  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.69 
 
 
291 aa  261  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0032  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.69 
 
 
291 aa  261  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0033  hypothetical protein  46.69 
 
 
291 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0041  tetrapyrrole methylase family protein  46.69 
 
 
291 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0031  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.69 
 
 
291 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5229  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.93 
 
 
293 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.291092  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0029  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.27 
 
 
303 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.9 
 
 
299 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.19 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  50 
 
 
293 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0064  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.53 
 
 
281 aa  251  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1105  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.76 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2101  hypothetical protein  45.62 
 
 
280 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000956385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1545  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.91 
 
 
284 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  50 
 
 
320 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  50 
 
 
282 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0046  hypothetical protein  57.14 
 
 
307 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000617643  hitchhiker  0.00000342991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0035  hypothetical protein  45.26 
 
 
287 aa  245  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0515864  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0163  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.73 
 
 
282 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000433503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  49.09 
 
 
304 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  50.36 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1602  hypothetical protein  45.29 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00301963  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  48.91 
 
 
289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.39 
 
 
294 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.39 
 
 
291 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  49.82 
 
 
281 aa  241  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0104  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.32 
 
 
288 aa  241  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000059008  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  47.81 
 
 
287 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.97 
 
 
291 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  48.9 
 
 
287 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0366  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.64 
 
 
274 aa  238  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000614532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.15 
 
 
280 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.7 
 
 
280 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  48.03 
 
 
286 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  52.7 
 
 
280 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  45.79 
 
 
292 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0039  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.54 
 
 
282 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.350447  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_329  tetrapyrrole methylase  48 
 
 
274 aa  235  6e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000393533  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  46.95 
 
 
291 aa  234  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.7 
 
 
280 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20320  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.4 
 
 
286 aa  234  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0386  tetrapyrrole methylase family protein  48.36 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00029302  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.7 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  46.52 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0282  methyltransferase  44.89 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.559196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  47.04 
 
 
281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  55.61 
 
 
299 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  55.61 
 
 
299 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  47.25 
 
 
281 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  53.18 
 
 
287 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.48 
 
 
295 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  55.61 
 
 
299 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4999  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.88 
 
 
234 aa  231  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00012249  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.99 
 
 
291 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.12 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  46.89 
 
 
281 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  46.35 
 
 
281 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  53.81 
 
 
286 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.81 
 
 
286 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.57 
 
 
280 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  53.81 
 
 
286 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  53.81 
 
 
286 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  47.67 
 
 
286 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  53.81 
 
 
287 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  53.81 
 
 
286 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  46.89 
 
 
281 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.67 
 
 
286 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3005  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.38 
 
 
293 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.773008  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3047  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.38 
 
 
293 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.507596  normal  0.829131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.36 
 
 
287 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  47.06 
 
 
281 aa  228  6e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3692  hypothetical protein  48.07 
 
 
281 aa  228  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  53.42 
 
 
288 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0414  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.88 
 
 
239 aa  227  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  46.26 
 
 
286 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1572  tetrapyrrole methylase family protein  44.44 
 
 
287 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0240  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.59 
 
 
246 aa  226  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0449  hypothetical protein  44.04 
 
 
291 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  52.47 
 
 
287 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  52.47 
 
 
287 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>