More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1119 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4335  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  93.03 
 
 
287 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743179  normal  0.137382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  84.97 
 
 
286 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  84.12 
 
 
295 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  84.07 
 
 
295 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  85.31 
 
 
286 aa  477  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  85.31 
 
 
286 aa  477  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  85.31 
 
 
286 aa  477  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  85.31 
 
 
287 aa  477  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  85.31 
 
 
286 aa  477  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  82.71 
 
 
295 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  84.97 
 
 
286 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  83.97 
 
 
287 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  83.97 
 
 
287 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  84.97 
 
 
286 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  83.97 
 
 
287 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  83.62 
 
 
287 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  84.62 
 
 
286 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  83.45 
 
 
292 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  83.62 
 
 
287 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  83.57 
 
 
288 aa  451  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  69.12 
 
 
287 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  68.07 
 
 
287 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  67.02 
 
 
287 aa  384  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  66.91 
 
 
288 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  65.22 
 
 
281 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  63.84 
 
 
280 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  59.64 
 
 
280 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  62.36 
 
 
280 aa  347  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  59.64 
 
 
280 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  60.29 
 
 
281 aa  342  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  62.13 
 
 
280 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  62.13 
 
 
280 aa  341  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  62.13 
 
 
280 aa  341  8e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.4 
 
 
280 aa  340  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  62.27 
 
 
281 aa  338  7e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  62.27 
 
 
281 aa  338  8e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.76 
 
 
280 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  56.73 
 
 
282 aa  336  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  62.59 
 
 
280 aa  335  5e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  58.89 
 
 
280 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  61.54 
 
 
287 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  61.54 
 
 
281 aa  333  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  61.17 
 
 
281 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  57.84 
 
 
299 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  58.42 
 
 
293 aa  331  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  58.25 
 
 
289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  58.1 
 
 
304 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  58.76 
 
 
286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  59.07 
 
 
294 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  59.14 
 
 
291 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  59.07 
 
 
291 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  59.07 
 
 
291 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  55.47 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  59.86 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  59.86 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3692  hypothetical protein  55.72 
 
 
281 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  56.74 
 
 
287 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.24 
 
 
272 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  50.91 
 
 
291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3144  putative methyltransferase  52.54 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  54.87 
 
 
281 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  47.35 
 
 
292 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  53.03 
 
 
265 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.22 
 
 
273 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2203  hypothetical protein  52.92 
 
 
282 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.826131  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0496  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.96 
 
 
309 aa  271  7e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.792442  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  51.85 
 
 
273 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2393  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.46 
 
 
293 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957737  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0504  hypothetical protein  51.46 
 
 
279 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.48072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  50.74 
 
 
291 aa  265  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2462  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.54 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0196  hypothetical protein  50 
 
 
288 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312709  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.12 
 
 
289 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.12 
 
 
289 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.63 
 
 
291 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.55 
 
 
307 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  51.99 
 
 
292 aa  249  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  53.06 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.82 
 
 
276 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0108  hypothetical protein  51.11 
 
 
397 aa  242  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0368422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2199  hypothetical protein  46.28 
 
 
318 aa  242  5e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00171139  decreased coverage  0.00853056 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0263  tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methylase family protein  48.39 
 
 
285 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1909  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.31 
 
 
319 aa  240  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848653  hitchhiker  0.0046163 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1930  hypothetical protein  48.39 
 
 
285 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.910019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.9 
 
 
282 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.45 
 
 
276 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0122  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.32 
 
 
291 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4593  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.57 
 
 
305 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0315173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2211  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.53 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.165354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5229  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.62 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.291092  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0404  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.86 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1545  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.69 
 
 
284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  47.25 
 
 
286 aa  232  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.39 
 
 
295 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3390  methyltransferase  48.91 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2924  hypothetical protein  47.43 
 
 
283 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3067  hypothetical protein  46.38 
 
 
283 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>