More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3544 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3544  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  100 
 
 
320 aa  634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4330  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  76.77 
 
 
305 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4593  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  75.77 
 
 
305 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0315173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  75.86 
 
 
306 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.28 
 
 
303 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4011  hypothetical protein  61.74 
 
 
303 aa  331  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.301912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0177  tetrapyrrole methylase family protein  65 
 
 
285 aa  325  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0897585  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0171  tetrapyrrole methylase family protein  65 
 
 
285 aa  325  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1043  tetrapyrrole methylase family protein  51.85 
 
 
301 aa  291  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.210407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0321  hypothetical protein  50.67 
 
 
317 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0326  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.34 
 
 
318 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0025  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.05 
 
 
317 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3497  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  55.6 
 
 
306 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0340  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.42 
 
 
320 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124929  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0022  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.61 
 
 
347 aa  252  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0674688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0421  hypothetical protein  53.61 
 
 
324 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0496  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.09 
 
 
309 aa  249  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.792442  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3585  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  56 
 
 
291 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0899  hypothetical protein  50.54 
 
 
285 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0147  hypothetical protein  50.69 
 
 
314 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3013  hypothetical protein  50.36 
 
 
300 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0448  hypothetical protein  51.24 
 
 
287 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149226  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.68 
 
 
287 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0399  hypothetical protein  52.09 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.39 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  48.9 
 
 
281 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  48.16 
 
 
281 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2084  hypothetical protein  52.73 
 
 
278 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  48.9 
 
 
281 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0405  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.18 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1813  hypothetical protein  53 
 
 
295 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3693  hypothetical protein  53.9 
 
 
307 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.929135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0460  Fis family transcriptional regulator  53 
 
 
295 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2939  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  58.04 
 
 
323 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  48.72 
 
 
288 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.65 
 
 
280 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  47.79 
 
 
280 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.55 
 
 
316 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0355005  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0292  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.09 
 
 
329 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0471  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.88 
 
 
295 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.13 
 
 
280 aa  235  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0115  hypothetical protein  54.1 
 
 
317 aa  235  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  48.34 
 
 
281 aa  235  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0473  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.82 
 
 
316 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  47.43 
 
 
281 aa  232  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.27 
 
 
280 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.68 
 
 
289 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.1 
 
 
280 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.68 
 
 
289 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  48.15 
 
 
286 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.91 
 
 
280 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  47.94 
 
 
280 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.91 
 
 
280 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  45.76 
 
 
280 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0571  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.21 
 
 
293 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646781  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.91 
 
 
280 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0174  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.24 
 
 
294 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  46.15 
 
 
287 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  48.16 
 
 
287 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.49 
 
 
282 aa  225  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.9 
 
 
307 aa  225  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3117  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.7 
 
 
339 aa  225  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0035  hypothetical protein  44.44 
 
 
287 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0515864  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  45.49 
 
 
281 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  48.52 
 
 
286 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.52 
 
 
286 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  48.52 
 
 
287 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  48.52 
 
 
286 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  48.52 
 
 
286 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.86 
 
 
291 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0182  putative methyltransferase  56.05 
 
 
297 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.15 
 
 
286 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  45.99 
 
 
287 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  48.15 
 
 
286 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3958  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.66 
 
 
302 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1602  hypothetical protein  40.66 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00301963  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.78 
 
 
295 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  47.25 
 
 
287 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  47.25 
 
 
287 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  47.25 
 
 
287 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0031  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.29 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  47.78 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1105  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.36 
 
 
279 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.46 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.37 
 
 
273 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.44 
 
 
278 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0653  tetrapyrrole methylase family protein  46.04 
 
 
286 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0748907  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  47.92 
 
 
287 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.49 
 
 
276 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0240  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.88 
 
 
246 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  49.81 
 
 
273 aa  218  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.52 
 
 
282 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.13 
 
 
276 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.67 
 
 
295 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  43.22 
 
 
291 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  47.39 
 
 
292 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  45.05 
 
 
287 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0031  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.11 
 
 
291 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0060  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.64 
 
 
273 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000025326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>