More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0559 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  100 
 
 
287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  99.65 
 
 
286 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  99.65 
 
 
286 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  99.65 
 
 
286 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  99.3 
 
 
286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  97.54 
 
 
287 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  97.54 
 
 
287 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  97.54 
 
 
287 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  96.84 
 
 
287 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  97.19 
 
 
287 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  92.31 
 
 
288 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  85.31 
 
 
299 aa  477  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  85.31 
 
 
299 aa  477  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  85.31 
 
 
299 aa  477  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  82.87 
 
 
295 aa  470  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  82.17 
 
 
295 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  82.17 
 
 
295 aa  464  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  80.92 
 
 
292 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4335  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  83.51 
 
 
287 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743179  normal  0.137382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  68.42 
 
 
287 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  68.42 
 
 
287 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  66.55 
 
 
288 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  67.63 
 
 
281 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  67.94 
 
 
287 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  66.05 
 
 
280 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  64.34 
 
 
281 aa  358  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  64.58 
 
 
280 aa  351  7e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  62.59 
 
 
280 aa  349  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  61.76 
 
 
280 aa  348  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  62.13 
 
 
280 aa  348  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  63 
 
 
281 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  59.85 
 
 
282 aa  345  6e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  63.24 
 
 
280 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  63.24 
 
 
280 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  63 
 
 
281 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  63.24 
 
 
280 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  62.27 
 
 
281 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  64.07 
 
 
280 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  59.72 
 
 
299 aa  342  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  62.5 
 
 
280 aa  342  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  62.87 
 
 
280 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  62.27 
 
 
281 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  60.87 
 
 
287 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  57.86 
 
 
293 aa  330  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  57.3 
 
 
289 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  57.65 
 
 
304 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  58.82 
 
 
286 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  60.64 
 
 
294 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  60.64 
 
 
291 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  60.28 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  59.57 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3692  hypothetical protein  57.72 
 
 
281 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  61.29 
 
 
282 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  61.29 
 
 
320 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  57.09 
 
 
287 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  52.73 
 
 
281 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  55.85 
 
 
272 aa  295  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2393  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.84 
 
 
293 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957737  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3144  putative methyltransferase  55.11 
 
 
280 aa  294  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2203  hypothetical protein  54.84 
 
 
282 aa  291  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.826131  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  48.77 
 
 
292 aa  287  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.33 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  52.96 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  53.99 
 
 
265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  55.43 
 
 
281 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  50.18 
 
 
291 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  48.76 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0504  hypothetical protein  53.28 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.48072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0496  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.41 
 
 
309 aa  269  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.792442  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2462  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.71 
 
 
287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.55 
 
 
289 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.55 
 
 
289 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0263  tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methylase family protein  50.72 
 
 
285 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1930  hypothetical protein  50.72 
 
 
285 aa  258  6e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.910019  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.74 
 
 
307 aa  255  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0196  hypothetical protein  52.01 
 
 
288 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312709  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  52.85 
 
 
291 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  51.47 
 
 
292 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  49.28 
 
 
286 aa  248  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.55 
 
 
282 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  53.66 
 
 
285 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2199  hypothetical protein  45.6 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00171139  decreased coverage  0.00853056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2211  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.92 
 
 
293 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.165354 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1909  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.48 
 
 
319 aa  242  5e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848653  hitchhiker  0.0046163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1545  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.1 
 
 
284 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.67 
 
 
276 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2924  hypothetical protein  46.91 
 
 
283 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3067  hypothetical protein  47.06 
 
 
283 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0108  hypothetical protein  49.81 
 
 
397 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0368422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5229  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.72 
 
 
293 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.291092  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.73 
 
 
278 aa  235  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.67 
 
 
276 aa  235  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12801  putative tetrapyrrole methylase family protein  46.15 
 
 
306 aa  234  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.105851  normal  0.0426516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.64 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  47.78 
 
 
306 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3544  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.52 
 
 
320 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>