More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3753 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  69.93 
 
 
276 aa  387  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  69.93 
 
 
276 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2861  hypothetical protein  69.18 
 
 
282 aa  360  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189341  hitchhiker  0.000000116322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0653  tetrapyrrole methylase family protein  65.09 
 
 
286 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0748907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.17 
 
 
282 aa  337  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  60 
 
 
278 aa  322  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0060  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.37 
 
 
273 aa  278  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000025326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2215  putative tetrapyrrole methylase family protein  53.6 
 
 
285 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0029  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50 
 
 
303 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0034  hypothetical protein  49.27 
 
 
291 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0035  hypothetical protein  49.27 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0032  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.27 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0032  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.27 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0033  hypothetical protein  49.27 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0041  tetrapyrrole methylase family protein  49.27 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0045  tetrapyrrole methylase family protein  49.27 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0031  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.91 
 
 
291 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  51.07 
 
 
285 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5275  tetrapyrrole methylase family protein  48.54 
 
 
291 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0041  tetrapyrrole methylase family protein  48.54 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0063  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.19 
 
 
286 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000661848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0031  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.91 
 
 
291 aa  265  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.29 
 
 
289 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.29 
 
 
289 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.18 
 
 
291 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0031  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.25 
 
 
290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0163  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.64 
 
 
282 aa  258  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000433503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20320  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.26 
 
 
286 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5229  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.11 
 
 
293 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.291092  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2101  hypothetical protein  46.89 
 
 
280 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000956385  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.34 
 
 
280 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.34 
 
 
280 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  47.89 
 
 
292 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1105  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.75 
 
 
279 aa  249  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.34 
 
 
280 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  48.54 
 
 
280 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.34 
 
 
280 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0035  hypothetical protein  45.71 
 
 
287 aa  248  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0515864  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0104  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.02 
 
 
288 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000059008  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1545  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.01 
 
 
284 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0046  hypothetical protein  49.27 
 
 
307 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000617643  hitchhiker  0.00000342991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  54.34 
 
 
281 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_329  tetrapyrrole methylase  48.94 
 
 
274 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000393533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  54.3 
 
 
281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.42 
 
 
280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0039  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  56.5 
 
 
282 aa  244  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.350447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.54 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0386  tetrapyrrole methylase family protein  48.75 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00029302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0025  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.1 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  53.88 
 
 
281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  52.97 
 
 
281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.08 
 
 
280 aa  242  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.91 
 
 
280 aa  241  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0366  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.01 
 
 
274 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000614532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  48.41 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  49.28 
 
 
287 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3910  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.95 
 
 
281 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1602  hypothetical protein  44.25 
 
 
279 aa  237  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00301963  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  47.08 
 
 
280 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  46.81 
 
 
293 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  47.83 
 
 
289 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  48 
 
 
286 aa  235  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  48.93 
 
 
281 aa  235  7e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  46.29 
 
 
304 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  53.36 
 
 
320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  53.36 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  45.1 
 
 
286 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2117  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.36 
 
 
276 aa  232  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000303405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  47.86 
 
 
288 aa  232  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4999  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.68 
 
 
234 aa  232  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00012249  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  46.89 
 
 
280 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.52 
 
 
280 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  46.59 
 
 
287 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.49 
 
 
294 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  48.06 
 
 
291 aa  229  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.49 
 
 
291 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  45.62 
 
 
292 aa  229  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.65 
 
 
273 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  47.84 
 
 
287 aa  228  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0064  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.34 
 
 
281 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1813  hypothetical protein  45.88 
 
 
295 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0334  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.26 
 
 
288 aa  227  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0022  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.75 
 
 
347 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0674688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3919  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.43 
 
 
297 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0903297  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.52 
 
 
286 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0460  Fis family transcriptional regulator  45.88 
 
 
295 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.28 
 
 
291 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  47.29 
 
 
273 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1572  tetrapyrrole methylase family protein  44.65 
 
 
287 aa  225  7e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  46.34 
 
 
281 aa  225  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3497  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.12 
 
 
306 aa  225  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  44.68 
 
 
306 aa  225  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.46 
 
 
292 aa  225  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  50.43 
 
 
286 aa  224  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  50.87 
 
 
286 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.87 
 
 
286 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  50.87 
 
 
286 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0185  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.66 
 
 
224 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  50.87 
 
 
286 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>