More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0301 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  100 
 
 
281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  97.15 
 
 
281 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  97.15 
 
 
281 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  95.37 
 
 
281 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  92.88 
 
 
280 aa  520  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  92.53 
 
 
280 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  92.17 
 
 
280 aa  517  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  91.81 
 
 
280 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  91.81 
 
 
280 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  80.43 
 
 
280 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  81.49 
 
 
280 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  80.07 
 
 
280 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  77.94 
 
 
280 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  79.06 
 
 
280 aa  454  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  77.58 
 
 
280 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  74.28 
 
 
281 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  67.03 
 
 
288 aa  378  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  65.83 
 
 
287 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  62.32 
 
 
287 aa  361  9e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  65.47 
 
 
287 aa  357  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  61.9 
 
 
286 aa  351  8e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  62.64 
 
 
287 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  62.77 
 
 
295 aa  338  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  62.64 
 
 
287 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  62.64 
 
 
287 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  62.77 
 
 
295 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  62.64 
 
 
286 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  62.5 
 
 
292 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  62.27 
 
 
286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  62.27 
 
 
286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  62.27 
 
 
286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  62.41 
 
 
295 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  62.27 
 
 
287 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  62.27 
 
 
286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  62.73 
 
 
287 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.9 
 
 
286 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  61.9 
 
 
286 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  61.17 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.17 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  61.17 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  60.44 
 
 
286 aa  325  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  62.27 
 
 
287 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  56.36 
 
 
299 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  57.56 
 
 
282 aa  321  7e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  57.14 
 
 
293 aa  321  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  58.24 
 
 
289 aa  318  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  56.83 
 
 
281 aa  318  7.999999999999999e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  57.09 
 
 
304 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  56.99 
 
 
287 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  62.27 
 
 
288 aa  316  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4335  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.17 
 
 
287 aa  311  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743179  normal  0.137382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3144  putative methyltransferase  59.64 
 
 
280 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  58.09 
 
 
294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  58.09 
 
 
291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  58.46 
 
 
291 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  55.2 
 
 
292 aa  305  7e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  56.99 
 
 
291 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3692  hypothetical protein  56.99 
 
 
281 aa  295  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  52.57 
 
 
281 aa  293  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  55.81 
 
 
272 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  55.88 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  55.88 
 
 
320 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  56.99 
 
 
287 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.11 
 
 
273 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  53.11 
 
 
273 aa  279  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2393  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.26 
 
 
293 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957737  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0496  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.77 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.792442  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  52.83 
 
 
265 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2462  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.11 
 
 
287 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  50.55 
 
 
291 aa  265  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2203  hypothetical protein  51.65 
 
 
282 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.826131  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.83 
 
 
307 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  50 
 
 
286 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  48.72 
 
 
291 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1909  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.67 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848653  hitchhiker  0.0046163 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2199  hypothetical protein  50 
 
 
318 aa  253  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00171139  decreased coverage  0.00853056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0504  hypothetical protein  50.9 
 
 
279 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.48072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.89 
 
 
282 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3544  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.16 
 
 
320 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.99 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0263  tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methylase family protein  50.74 
 
 
285 aa  242  6e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1930  hypothetical protein  50.74 
 
 
285 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.910019  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.4 
 
 
289 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.4 
 
 
289 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0201  hypothetical protein  47.81 
 
 
296 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3390  methyltransferase  47.79 
 
 
293 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  43.75 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0677  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.07 
 
 
326 aa  235  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0215  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.79 
 
 
296 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.89 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1545  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.26 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338638 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0334  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.18 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  46.4 
 
 
306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  47.65 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0060  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.64 
 
 
273 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000025326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.25 
 
 
276 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0240  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  52.04 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.86 
 
 
295 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4593  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.52 
 
 
305 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0315173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0289  hypothetical protein  46.84 
 
 
276 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>