58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0358 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0358  metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 		 282 aa  583  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1733  metal-dependent hydrolase-like protein  36.53 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  26.05 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4095  hypothetical protein  24.5 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440688  normal  0.496826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  27.75 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  29.69 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  30.13 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  30.07 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  27.96 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3627  hypothetical protein  23.63 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3554  hypothetical protein  23.63 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  27.42 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  27.42 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3559  hypothetical protein  24.19 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  27.42 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  30.13 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  27.42 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  26.34 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  31.36 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  26.78 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  26.88 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  26.88 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3497  hypothetical protein  29.36 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.173703 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  26.88 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  25.16 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  23.81 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3010  hypothetical protein  27.52 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  27.46 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  26.23 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  26.26 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2466  Uncharacterized conserved protein UCP07580  22.78 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  26.63 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  26.63 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  26.63 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  26.63 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  23.81 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  23.62 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  26.63 
 
 		 434 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  22.88 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  26.81 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  31.09 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  22.88 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  28.49 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  23.25 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  28.49 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  28.03 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  23.25 
 
 		 440 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  24.73 
 
 		 356 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  34.82 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  29.03 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  24.86 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  28.1 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  22.79 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  27.52 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  22.89 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  25.52 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  30.77 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>