184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30080  predicted CoA-binding protein  100 
 
 		 143 aa  279  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  53.24 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  52.67 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  50.36 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  47.41 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  48.41 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  42.11 
 
 		 176 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  44.78 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  45.45 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  40.98 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  46.88 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  39.85 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  39.23 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  39.37 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  37.78 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  40.77 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  39.5 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  37.04 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  43.38 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  36.29 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  33.07 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  37.59 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  34.88 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  36.84 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  41.13 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  34.88 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  36.3 
 
 		 198 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  36.84 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  36.84 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  32.8 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  36.84 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  36.84 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  36.84 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  41.13 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  35.07 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  38.97 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  38.02 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  40.77 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  40.31 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  36.22 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  36.22 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  36.22 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  38.35 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  36.22 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  36.22 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  36.22 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  37.01 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  36.22 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  36.22 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  36.22 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  39.53 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  36.29 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  39.52 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  44.35 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  33.86 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  32.82 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  36.72 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  40.5 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  37.29 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  39.71 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  37.82 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  37.3 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  39.2 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  32.03 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  32.28 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 537 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  34.62 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  37.7 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1014  CoA-binding domain protein  37.61 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  35.11 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0095  CoA-binding domain protein  37.98 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  34.81 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  41.6 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  37.4 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  31.54 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  38.79 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  35.77 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  35.77 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  32.06 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  33.59 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  28.8 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  34.07 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.100452 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>