100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3526 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3526  acetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
308 aa  610  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3901  acetaldehyde dehydrogenase  91.56 
 
 
308 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4924  acetaldehyde dehydrogenase  67.66 
 
 
313 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758356  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9114  Acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  71.67 
 
 
325 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08700  acetaldehyde dehydrogenase  67.43 
 
 
318 aa  404  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3547  acetaldehyde dehydrogenase  65.69 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2889  acetaldehyde dehydrogenase  64.19 
 
 
314 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.263365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2883  acetaldehyde dehydrogenase  68.21 
 
 
324 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1983  acetaldehyde dehydrogenase  67.22 
 
 
310 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.557504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4392  acetaldehyde dehydrogenase  66.99 
 
 
318 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1151  acetaldehyde dehydrogenase  68.44 
 
 
313 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923632  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5208  acetaldehyde dehydrogenase  68.46 
 
 
314 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2008  acetaldehyde dehydrogenase  67.33 
 
 
315 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5824  acetaldehyde dehydrogenase  66.34 
 
 
313 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42130  acetaldehyde dehydrogenase  67.55 
 
 
312 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0998918  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7645  acetaldehyde dehydrogenase  69.28 
 
 
314 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2874  acetaldehyde dehydrogenase  64.61 
 
 
316 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0199395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1467  acetaldehyde dehydrogenase  69.31 
 
 
314 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3239  acetaldehyde dehydrogenase  65.25 
 
 
314 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.122031  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15120  acetaldehyde dehydrogenase  67.22 
 
 
311 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00305  acetaldehyde dehydrogenase  64.19 
 
 
316 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3274  acetaldehyde dehydrogenase  64.19 
 
 
316 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0415  acetaldehyde dehydrogenase  64.19 
 
 
316 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2326  acetaldehyde dehydrogenase  66.78 
 
 
313 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0375  acetaldehyde dehydrogenase  64.19 
 
 
316 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0382  acetaldehyde dehydrogenase  64.19 
 
 
316 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.708162  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00309  hypothetical protein  64.19 
 
 
316 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3255  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  64.19 
 
 
316 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2112  acetaldehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
314 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1640  acetaldehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
314 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  0.308557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4538  acetaldehyde dehydrogenase  66.01 
 
 
315 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5135  acetaldehyde dehydrogenase  67.01 
 
 
314 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276466  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0426  acetaldehyde dehydrogenase  64.52 
 
 
316 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1478  acetaldehyde dehydrogenase  60.86 
 
 
313 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4744  acetaldehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
308 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3511  acetaldehyde dehydrogenase  63.55 
 
 
315 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0937  acetaldehyde dehydrogenase  61.56 
 
 
315 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843977  normal  0.431333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1187  acetaldehyde dehydrogenase  61.51 
 
 
319 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139371  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1650  acetaldehyde dehydrogenase  63.96 
 
 
314 aa  364  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2150  acetaldehyde dehydrogenase  63.58 
 
 
314 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01665  acetaldehyde dehydrogenase  65.85 
 
 
306 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188188  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5834  acetaldehyde dehydrogenase  60.26 
 
 
315 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5437  acetaldehyde dehydrogenase  60.26 
 
 
315 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.747247 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3688  acetaldehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
311 aa  348  6e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3853  acetaldehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
312 aa  342  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2411  acetaldehyde dehydrogenase  57.93 
 
 
305 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13568  acetaldehyde dehydrogenase  59.8 
 
 
303 aa  332  6e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2572  acetaldehyde dehydrogenase  55.99 
 
 
305 aa  330  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384825  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2297  acetaldehyde dehydrogenase  54.46 
 
 
299 aa  329  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2033  acetaldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
303 aa  329  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1391  acetaldehyde dehydrogenase  56.09 
 
 
320 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0258079 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3542  acetaldehyde dehydrogenase  59.8 
 
 
311 aa  328  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.121527  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4618  acetaldehyde dehydrogenase  59.8 
 
 
311 aa  328  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342032  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0223  acetaldehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
302 aa  328  8e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2117  acetaldehyde dehydrogenase  55.92 
 
 
307 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4143  acetaldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.369234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2782  acetaldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
303 aa  326  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1320  acetaldehyde dehydrogenase  58.8 
 
 
303 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197836  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0535  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  59.32 
 
 
303 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1188  acetaldehyde dehydrogenase  56.48 
 
 
304 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625334  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3802  acetaldehyde dehydrogenase  54.28 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2267  acetaldehyde dehydrogenase  57.53 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3341  acetaldehyde dehydrogenase  56.15 
 
 
305 aa  318  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2078  acetaldehyde dehydrogenase  57.86 
 
 
307 aa  318  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2461  acetaldehyde dehydrogenase  59.33 
 
 
300 aa  318  7.999999999999999e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.398437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3106  acetaldehyde dehydrogenase  57.86 
 
 
307 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000261954  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3801  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  57.28 
 
 
302 aa  317  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4223  acetaldehyde dehydrogenase  57.1 
 
 
313 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.479917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3471  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  57 
 
 
298 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1521  acetaldehyde dehydrogenase  55.16 
 
 
306 aa  315  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0906  acetaldehyde dehydrogenase  57.43 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0619702  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1458  acetaldehyde dehydrogenase  56.83 
 
 
299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656772  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4082  acetaldehyde dehydrogenase  58.7 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3783  acetaldehyde dehydrogenase  55.48 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0703943  hitchhiker  0.00243218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2156  acetaldehyde dehydrogenase  53.85 
 
 
299 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1355  acetaldehyde dehydrogenase  55.48 
 
 
304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000494907  decreased coverage  0.00000135829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1620  acetaldehyde dehydrogenase  56.04 
 
 
299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0455  acetaldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5235  acetaldehyde dehydrogenase  54.49 
 
 
306 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.264485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3807  acetaldehyde dehydrogenase  53.9 
 
 
305 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30580  acetaldehyde dehydrogenase  55.59 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000481104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0910  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  54.82 
 
 
301 aa  301  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0596  acetaldehyde dehydrogenase  54.87 
 
 
315 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5043  acetaldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 
310 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1776  acetaldehyde dehydrogenase  54.15 
 
 
291 aa  298  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4748  acetaldehyde dehydrogenase  55.52 
 
 
310 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473939  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4660  acetaldehyde dehydrogenase  55.52 
 
 
310 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2960  acetaldehyde dehydrogenase  57.97 
 
 
306 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1244  acetaldehyde dehydrogenase  51 
 
 
297 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3322  acetaldehyde dehydrogenase  55.59 
 
 
307 aa  292  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4744  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  54.46 
 
 
289 aa  291  8e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0440  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  58.31 
 
 
294 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237883  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0239  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  53.31 
 
 
292 aa  281  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2455  acetaldehyde dehydrogenase  44.9 
 
 
297 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2591  acetaldehyde dehydrogenase  44.9 
 
 
297 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0891  acetaldehyde dehydrogenase  44.9 
 
 
297 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0569  acetaldehyde dehydrogenase  43.2 
 
 
297 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4834  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  42.16 
 
 
325 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3026  acetaldehyde dehydrogenase  37.86 
 
 
295 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4566  acetaldehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
295 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  hitchhiker  0.000386347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>