101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0455 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0455  acetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 306 aa  623  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2078  acetaldehyde dehydrogenase  85.91 
 
 		 307 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3106  acetaldehyde dehydrogenase  86.24 
 
 		 307 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000261954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0906  acetaldehyde dehydrogenase  84.77 
 
 		 304 aa  535  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0619702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4143  acetaldehyde dehydrogenase  82.78 
 
 		 304 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.369234 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4618  acetaldehyde dehydrogenase  83.67 
 
 		 311 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3542  acetaldehyde dehydrogenase  83.67 
 
 		 311 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.121527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3783  acetaldehyde dehydrogenase  82.45 
 
 		 304 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0703943  hitchhiker  0.00243218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1188  acetaldehyde dehydrogenase  82.45 
 
 		 304 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1355  acetaldehyde dehydrogenase  82.12 
 
 		 304 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000494907  decreased coverage  0.00000135829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1320  acetaldehyde dehydrogenase  81.33 
 
 		 303 aa  520  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197836  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3341  acetaldehyde dehydrogenase  81.91 
 
 		 305 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0223  acetaldehyde dehydrogenase  81.33 
 
 		 302 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2267  acetaldehyde dehydrogenase  82.55 
 
 		 303 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2782  acetaldehyde dehydrogenase  79.4 
 
 		 303 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2960  acetaldehyde dehydrogenase  80.41 
 
 		 306 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3807  acetaldehyde dehydrogenase  74.33 
 
 		 305 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1458  acetaldehyde dehydrogenase  79.45 
 
 		 299 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3322  acetaldehyde dehydrogenase  70.49 
 
 		 307 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2117  acetaldehyde dehydrogenase  72.33 
 
 		 307 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30580  acetaldehyde dehydrogenase  72.73 
 
 		 304 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000481104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2461  acetaldehyde dehydrogenase  75.43 
 
 		 300 aa  454  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.398437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3802  acetaldehyde dehydrogenase  68.23 
 
 		 303 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.813125 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1391  acetaldehyde dehydrogenase  68.98 
 
 		 320 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0258079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3801  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  59.74 
 
 		 302 aa  354  8.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5235  acetaldehyde dehydrogenase  57.28 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13568  acetaldehyde dehydrogenase  56.15 
 
 		 303 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208142 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1620  acetaldehyde dehydrogenase  58.08 
 
 		 299 aa  342  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1521  acetaldehyde dehydrogenase  56.62 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3471  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  58.84 
 
 		 298 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4223  acetaldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 		 313 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.479917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4082  acetaldehyde dehydrogenase  58.16 
 
 		 315 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000504143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3239  acetaldehyde dehydrogenase  57.73 
 
 		 314 aa  331  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.122031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2411  acetaldehyde dehydrogenase  55.45 
 
 		 305 aa  330  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4392  acetaldehyde dehydrogenase  56.54 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0910  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  55.48 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0535  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  58.11 
 
 		 303 aa  329  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2156  acetaldehyde dehydrogenase  55.59 
 
 		 299 aa  328  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1640  acetaldehyde dehydrogenase  56.33 
 
 		 314 aa  328  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  0.308557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2112  acetaldehyde dehydrogenase  56.33 
 
 		 314 aa  328  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2326  acetaldehyde dehydrogenase  56.09 
 
 		 313 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4538  acetaldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 		 315 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4924  acetaldehyde dehydrogenase  56.05 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9114  Acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  55.26 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5824  acetaldehyde dehydrogenase  56.37 
 
 		 313 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1467  acetaldehyde dehydrogenase  57.82 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0440  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  60.34 
 
 		 294 aa  322  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237883  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1776  acetaldehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2572  acetaldehyde dehydrogenase  53.47 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5043  acetaldehyde dehydrogenase  54.4 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4660  acetaldehyde dehydrogenase  54.4 
 
 		 310 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4748  acetaldehyde dehydrogenase  54.4 
 
 		 310 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473939  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2297  acetaldehyde dehydrogenase  53.58 
 
 		 299 aa  319  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2033  acetaldehyde dehydrogenase  53.31 
 
 		 303 aa  318  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7645  acetaldehyde dehydrogenase  57.82 
 
 		 314 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3853  acetaldehyde dehydrogenase  56.07 
 
 		 312 aa  318  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1151  acetaldehyde dehydrogenase  53.31 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1983  acetaldehyde dehydrogenase  55.99 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.557504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3547  acetaldehyde dehydrogenase  56.25 
 
 		 314 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00305  acetaldehyde dehydrogenase  56.73 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3255  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  56.73 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0415  acetaldehyde dehydrogenase  56.73 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0375  acetaldehyde dehydrogenase  56.73 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3274  acetaldehyde dehydrogenase  56.73 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0382  acetaldehyde dehydrogenase  56.73 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.708162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00309  hypothetical protein  56.73 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2883  acetaldehyde dehydrogenase  55.34 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08700  acetaldehyde dehydrogenase  54.69 
 
 		 318 aa  315  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1187  acetaldehyde dehydrogenase  54.29 
 
 		 319 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139371  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3688  acetaldehyde dehydrogenase  55.63 
 
 		 311 aa  312  4.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5208  acetaldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 		 314 aa  311  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2874  acetaldehyde dehydrogenase  54.29 
 
 		 316 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3901  acetaldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2889  acetaldehyde dehydrogenase  56.11 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.263365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42130  acetaldehyde dehydrogenase  54.31 
 
 		 312 aa  308  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0998918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3526  acetaldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3511  acetaldehyde dehydrogenase  54.66 
 
 		 315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5437  acetaldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 		 315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.747247 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5834  acetaldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 		 315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15120  acetaldehyde dehydrogenase  54.66 
 
 		 311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2150  acetaldehyde dehydrogenase  55.48 
 
 		 314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0239  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  54.27 
 
 		 292 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1244  acetaldehyde dehydrogenase  52.17 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1650  acetaldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2008  acetaldehyde dehydrogenase  53.09 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4744  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  55.67 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0426  acetaldehyde dehydrogenase  56.41 
 
 		 316 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4744  acetaldehyde dehydrogenase  56.77 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01665  acetaldehyde dehydrogenase  54.61 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5135  acetaldehyde dehydrogenase  53.04 
 
 		 314 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276466  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1478  acetaldehyde dehydrogenase  52.56 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0937  acetaldehyde dehydrogenase  52.88 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843977  normal  0.431333 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0891  acetaldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2591  acetaldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2455  acetaldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4834  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  42.55 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0569  acetaldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0596  acetaldehyde dehydrogenase  42.39 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4566  acetaldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  hitchhiker  0.000386347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3026  acetaldehyde dehydrogenase  37.28 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>