102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4143 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4143  acetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
304 aa  621  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.369234 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1188  acetaldehyde dehydrogenase  95.72 
 
 
304 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625334  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0223  acetaldehyde dehydrogenase  91.33 
 
 
302 aa  567  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3341  acetaldehyde dehydrogenase  90.97 
 
 
305 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2782  acetaldehyde dehydrogenase  88.41 
 
 
303 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4618  acetaldehyde dehydrogenase  88 
 
 
311 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342032  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2078  acetaldehyde dehydrogenase  89.93 
 
 
307 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3106  acetaldehyde dehydrogenase  89.26 
 
 
307 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000261954  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3542  acetaldehyde dehydrogenase  88 
 
 
311 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.121527  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1320  acetaldehyde dehydrogenase  85.76 
 
 
303 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197836  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0906  acetaldehyde dehydrogenase  85.53 
 
 
304 aa  541  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0619702  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3783  acetaldehyde dehydrogenase  84.54 
 
 
304 aa  537  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0703943  hitchhiker  0.00243218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1355  acetaldehyde dehydrogenase  84.21 
 
 
304 aa  535  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000494907  decreased coverage  0.00000135829 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2267  acetaldehyde dehydrogenase  85.76 
 
 
303 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0455  acetaldehyde dehydrogenase  82.78 
 
 
306 aa  531  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2960  acetaldehyde dehydrogenase  84.46 
 
 
306 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3807  acetaldehyde dehydrogenase  74.09 
 
 
305 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3322  acetaldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 
307 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3802  acetaldehyde dehydrogenase  71.62 
 
 
303 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2117  acetaldehyde dehydrogenase  74.74 
 
 
307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30580  acetaldehyde dehydrogenase  72.73 
 
 
304 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000481104  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1458  acetaldehyde dehydrogenase  77.4 
 
 
299 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656772  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2461  acetaldehyde dehydrogenase  75.43 
 
 
300 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.398437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1391  acetaldehyde dehydrogenase  64.65 
 
 
320 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0258079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1620  acetaldehyde dehydrogenase  60.48 
 
 
299 aa  353  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3801  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  60.4 
 
 
302 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1521  acetaldehyde dehydrogenase  57.84 
 
 
306 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5235  acetaldehyde dehydrogenase  58.61 
 
 
306 aa  345  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.264485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13568  acetaldehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
303 aa  344  8e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208142 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4924  acetaldehyde dehydrogenase  59.87 
 
 
313 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758356  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2297  acetaldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 
299 aa  338  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3471  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  59.18 
 
 
298 aa  338  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0535  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  58.64 
 
 
303 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4392  acetaldehyde dehydrogenase  56.86 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4223  acetaldehyde dehydrogenase  55.92 
 
 
313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.479917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1640  acetaldehyde dehydrogenase  57.01 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  0.308557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2112  acetaldehyde dehydrogenase  57.01 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4082  acetaldehyde dehydrogenase  58.16 
 
 
315 aa  335  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2883  acetaldehyde dehydrogenase  56.91 
 
 
324 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3547  acetaldehyde dehydrogenase  57.89 
 
 
314 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3901  acetaldehyde dehydrogenase  57.86 
 
 
308 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3239  acetaldehyde dehydrogenase  59.12 
 
 
314 aa  332  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.122031  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2411  acetaldehyde dehydrogenase  56.11 
 
 
305 aa  331  9e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0910  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  55.81 
 
 
301 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2156  acetaldehyde dehydrogenase  55.78 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2889  acetaldehyde dehydrogenase  57.76 
 
 
314 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.263365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9114  Acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  55.78 
 
 
325 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1983  acetaldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.557504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3526  acetaldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0440  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  61.03 
 
 
294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237883  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2572  acetaldehyde dehydrogenase  53.59 
 
 
305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384825  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5824  acetaldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
313 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5043  acetaldehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
310 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4660  acetaldehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
310 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2150  acetaldehyde dehydrogenase  57.84 
 
 
314 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4748  acetaldehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
310 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473939  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2874  acetaldehyde dehydrogenase  56.83 
 
 
316 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0199395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4744  acetaldehyde dehydrogenase  59.41 
 
 
308 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42130  acetaldehyde dehydrogenase  56.55 
 
 
312 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0998918  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7645  acetaldehyde dehydrogenase  57.48 
 
 
314 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5437  acetaldehyde dehydrogenase  56.39 
 
 
315 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.747247 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5834  acetaldehyde dehydrogenase  56.39 
 
 
315 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3853  acetaldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1187  acetaldehyde dehydrogenase  54.95 
 
 
319 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139371  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1467  acetaldehyde dehydrogenase  56.8 
 
 
314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1151  acetaldehyde dehydrogenase  55.91 
 
 
313 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2326  acetaldehyde dehydrogenase  56.09 
 
 
313 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1776  acetaldehyde dehydrogenase  56.06 
 
 
291 aa  317  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2033  acetaldehyde dehydrogenase  54.18 
 
 
303 aa  317  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4538  acetaldehyde dehydrogenase  56.77 
 
 
315 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15120  acetaldehyde dehydrogenase  55.95 
 
 
311 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4744  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  56.36 
 
 
289 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5208  acetaldehyde dehydrogenase  55.23 
 
 
314 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.215668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00305  acetaldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3255  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  57.05 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0415  acetaldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0375  acetaldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3274  acetaldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0382  acetaldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.708162  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00309  hypothetical protein  57.05 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1244  acetaldehyde dehydrogenase  53.9 
 
 
297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2008  acetaldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 
315 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08700  acetaldehyde dehydrogenase  54.9 
 
 
318 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1650  acetaldehyde dehydrogenase  56.17 
 
 
314 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3688  acetaldehyde dehydrogenase  56.29 
 
 
311 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3511  acetaldehyde dehydrogenase  54.26 
 
 
315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0426  acetaldehyde dehydrogenase  57.37 
 
 
316 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0239  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  52.22 
 
 
292 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1478  acetaldehyde dehydrogenase  54.19 
 
 
313 aa  295  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01665  acetaldehyde dehydrogenase  53.58 
 
 
306 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188188  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0937  acetaldehyde dehydrogenase  53.18 
 
 
315 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843977  normal  0.431333 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5135  acetaldehyde dehydrogenase  51.69 
 
 
314 aa  288  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276466  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0596  acetaldehyde dehydrogenase  43.69 
 
 
315 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0891  acetaldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
297 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2591  acetaldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
297 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2455  acetaldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
297 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4834  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  42.03 
 
 
325 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0569  acetaldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
297 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4566  acetaldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
295 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  hitchhiker  0.000386347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3026  acetaldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>