101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1650 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1650  acetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
314 aa  624  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4924  acetaldehyde dehydrogenase  69.9 
 
 
313 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2883  acetaldehyde dehydrogenase  69.93 
 
 
324 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5824  acetaldehyde dehydrogenase  69.9 
 
 
313 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2889  acetaldehyde dehydrogenase  71.1 
 
 
314 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.263365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4538  acetaldehyde dehydrogenase  70.1 
 
 
315 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1983  acetaldehyde dehydrogenase  69.9 
 
 
310 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.557504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2326  acetaldehyde dehydrogenase  69.58 
 
 
313 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5437  acetaldehyde dehydrogenase  68.06 
 
 
315 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.747247 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5834  acetaldehyde dehydrogenase  68.06 
 
 
315 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08700  acetaldehyde dehydrogenase  69.9 
 
 
318 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3547  acetaldehyde dehydrogenase  69.38 
 
 
314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2150  acetaldehyde dehydrogenase  69.81 
 
 
314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15120  acetaldehyde dehydrogenase  69.13 
 
 
311 aa  404  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42130  acetaldehyde dehydrogenase  69.58 
 
 
312 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0998918  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7645  acetaldehyde dehydrogenase  71.33 
 
 
314 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2874  acetaldehyde dehydrogenase  68.81 
 
 
316 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0199395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1467  acetaldehyde dehydrogenase  71.62 
 
 
314 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3239  acetaldehyde dehydrogenase  68.93 
 
 
314 aa  398  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.122031  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4392  acetaldehyde dehydrogenase  69.93 
 
 
318 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5135  acetaldehyde dehydrogenase  71.38 
 
 
314 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276466  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5208  acetaldehyde dehydrogenase  68.28 
 
 
314 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4744  acetaldehyde dehydrogenase  69.81 
 
 
308 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00305  acetaldehyde dehydrogenase  65.51 
 
 
316 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3255  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  65.51 
 
 
316 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0415  acetaldehyde dehydrogenase  65.51 
 
 
316 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0375  acetaldehyde dehydrogenase  65.51 
 
 
316 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3274  acetaldehyde dehydrogenase  65.51 
 
 
316 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0382  acetaldehyde dehydrogenase  65.51 
 
 
316 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.708162  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2008  acetaldehyde dehydrogenase  67.2 
 
 
315 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00309  hypothetical protein  65.51 
 
 
316 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1187  acetaldehyde dehydrogenase  65.19 
 
 
319 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139371  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1151  acetaldehyde dehydrogenase  66.77 
 
 
313 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923632  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0937  acetaldehyde dehydrogenase  65.91 
 
 
315 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843977  normal  0.431333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3511  acetaldehyde dehydrogenase  67.21 
 
 
315 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9114  Acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  68.63 
 
 
325 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01665  acetaldehyde dehydrogenase  70.1 
 
 
306 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188188  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0426  acetaldehyde dehydrogenase  66.14 
 
 
316 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1478  acetaldehyde dehydrogenase  64.24 
 
 
313 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3901  acetaldehyde dehydrogenase  64.5 
 
 
308 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3526  acetaldehyde dehydrogenase  63.96 
 
 
308 aa  364  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1640  acetaldehyde dehydrogenase  62.75 
 
 
314 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  0.308557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2112  acetaldehyde dehydrogenase  62.75 
 
 
314 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3853  acetaldehyde dehydrogenase  60.06 
 
 
312 aa  345  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3688  acetaldehyde dehydrogenase  59.8 
 
 
311 aa  343  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0535  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  59.55 
 
 
303 aa  332  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3801  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  56.78 
 
 
302 aa  321  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13568  acetaldehyde dehydrogenase  58.12 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1458  acetaldehyde dehydrogenase  58.71 
 
 
299 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656772  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2411  acetaldehyde dehydrogenase  56.07 
 
 
305 aa  316  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5235  acetaldehyde dehydrogenase  57.98 
 
 
306 aa  314  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.264485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1620  acetaldehyde dehydrogenase  54.02 
 
 
299 aa  314  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2033  acetaldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2461  acetaldehyde dehydrogenase  59.09 
 
 
300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.398437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3106  acetaldehyde dehydrogenase  57.1 
 
 
307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000261954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0223  acetaldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
302 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2117  acetaldehyde dehydrogenase  55.34 
 
 
307 aa  311  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1188  acetaldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 
304 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625334  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2782  acetaldehyde dehydrogenase  56.13 
 
 
303 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3341  acetaldehyde dehydrogenase  56.45 
 
 
305 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1320  acetaldehyde dehydrogenase  55.48 
 
 
303 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197836  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4143  acetaldehyde dehydrogenase  56.17 
 
 
304 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.369234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2267  acetaldehyde dehydrogenase  56.45 
 
 
303 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4618  acetaldehyde dehydrogenase  56.82 
 
 
311 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342032  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3542  acetaldehyde dehydrogenase  56.82 
 
 
311 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.121527  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3471  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  57.43 
 
 
298 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1521  acetaldehyde dehydrogenase  57.52 
 
 
306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1391  acetaldehyde dehydrogenase  56.43 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0258079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4082  acetaldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
315 aa  309  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2156  acetaldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 
299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0906  acetaldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
304 aa  308  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0619702  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2078  acetaldehyde dehydrogenase  56.77 
 
 
307 aa  308  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30580  acetaldehyde dehydrogenase  55.31 
 
 
304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000481104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4223  acetaldehyde dehydrogenase  56.82 
 
 
313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.479917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2297  acetaldehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2572  acetaldehyde dehydrogenase  55.08 
 
 
305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384825  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1244  acetaldehyde dehydrogenase  52.1 
 
 
297 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3802  acetaldehyde dehydrogenase  54.05 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0455  acetaldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1776  acetaldehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
291 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3783  acetaldehyde dehydrogenase  53.57 
 
 
304 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0703943  hitchhiker  0.00243218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1355  acetaldehyde dehydrogenase  53.57 
 
 
304 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000494907  decreased coverage  0.00000135829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0596  acetaldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
315 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2960  acetaldehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
306 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3322  acetaldehyde dehydrogenase  54.05 
 
 
307 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3807  acetaldehyde dehydrogenase  53.55 
 
 
305 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0440  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  57.61 
 
 
294 aa  288  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237883  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0910  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  55.16 
 
 
301 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5043  acetaldehyde dehydrogenase  54.49 
 
 
310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4744  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  53.95 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4660  acetaldehyde dehydrogenase  54.02 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4748  acetaldehyde dehydrogenase  54.02 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473939  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0239  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  50.97 
 
 
292 aa  275  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0569  acetaldehyde dehydrogenase  44.08 
 
 
297 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0891  acetaldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
297 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2591  acetaldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
297 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2455  acetaldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
297 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4834  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  42.57 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4566  acetaldehyde dehydrogenase  41.02 
 
 
295 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  hitchhiker  0.000386347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3026  acetaldehyde dehydrogenase  40.85 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>