102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3341 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3341  acetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4143  acetaldehyde dehydrogenase  90.97 
 
 		 304 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.369234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0223  acetaldehyde dehydrogenase  91.61 
 
 		 302 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1188  acetaldehyde dehydrogenase  90.3 
 
 		 304 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2782  acetaldehyde dehydrogenase  90.07 
 
 		 303 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4618  acetaldehyde dehydrogenase  89.93 
 
 		 311 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3542  acetaldehyde dehydrogenase  89.93 
 
 		 311 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.121527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2078  acetaldehyde dehydrogenase  87.96 
 
 		 307 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3106  acetaldehyde dehydrogenase  87.96 
 
 		 307 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000261954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1320  acetaldehyde dehydrogenase  86 
 
 		 303 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197836  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2267  acetaldehyde dehydrogenase  85.95 
 
 		 303 aa  534  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0906  acetaldehyde dehydrogenase  84.95 
 
 		 304 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0619702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3783  acetaldehyde dehydrogenase  84.28 
 
 		 304 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0703943  hitchhiker  0.00243218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1355  acetaldehyde dehydrogenase  83.95 
 
 		 304 aa  527  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000494907  decreased coverage  0.00000135829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0455  acetaldehyde dehydrogenase  81.91 
 
 		 306 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2960  acetaldehyde dehydrogenase  85.37 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1458  acetaldehyde dehydrogenase  81.51 
 
 		 299 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3807  acetaldehyde dehydrogenase  73.36 
 
 		 305 aa  481  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2117  acetaldehyde dehydrogenase  75.58 
 
 		 307 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30580  acetaldehyde dehydrogenase  71.71 
 
 		 304 aa  471  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000481104  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3322  acetaldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 		 307 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3802  acetaldehyde dehydrogenase  73.06 
 
 		 303 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.813125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2461  acetaldehyde dehydrogenase  75.43 
 
 		 300 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.398437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1391  acetaldehyde dehydrogenase  69.1 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0258079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3801  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  59.47 
 
 		 302 aa  348  6e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1521  acetaldehyde dehydrogenase  60.14 
 
 		 306 aa  348  9e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5235  acetaldehyde dehydrogenase  59.4 
 
 		 306 aa  345  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1620  acetaldehyde dehydrogenase  57.24 
 
 		 299 aa  345  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13568  acetaldehyde dehydrogenase  58.53 
 
 		 303 aa  342  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4223  acetaldehyde dehydrogenase  56.77 
 
 		 313 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.479917 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4924  acetaldehyde dehydrogenase  58.47 
 
 		 313 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0535  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  57.91 
 
 		 303 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3471  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  58.16 
 
 		 298 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151518  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1640  acetaldehyde dehydrogenase  57.1 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  0.308557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2112  acetaldehyde dehydrogenase  57.1 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2297  acetaldehyde dehydrogenase  54.61 
 
 		 299 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2883  acetaldehyde dehydrogenase  57.19 
 
 		 324 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9114  Acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  57.43 
 
 		 325 aa  331  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3239  acetaldehyde dehydrogenase  59.05 
 
 		 314 aa  331  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.122031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3547  acetaldehyde dehydrogenase  58.22 
 
 		 314 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4392  acetaldehyde dehydrogenase  56.13 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1983  acetaldehyde dehydrogenase  59.02 
 
 		 310 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.557504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4082  acetaldehyde dehydrogenase  57.48 
 
 		 315 aa  329  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000504143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2411  acetaldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 		 305 aa  329  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3901  acetaldehyde dehydrogenase  58.19 
 
 		 308 aa  328  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0440  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  61.51 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237883  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4538  acetaldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2156  acetaldehyde dehydrogenase  55.48 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2889  acetaldehyde dehydrogenase  58.09 
 
 		 314 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.263365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0910  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  54.85 
 
 		 301 aa  325  5e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2150  acetaldehyde dehydrogenase  57.84 
 
 		 314 aa  324  9e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2326  acetaldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2033  acetaldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1776  acetaldehyde dehydrogenase  56.7 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2572  acetaldehyde dehydrogenase  53.92 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1467  acetaldehyde dehydrogenase  58.16 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5824  acetaldehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 313 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00305  acetaldehyde dehydrogenase  57.19 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3255  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  57.19 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7645  acetaldehyde dehydrogenase  57.77 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5043  acetaldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0415  acetaldehyde dehydrogenase  57.19 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0375  acetaldehyde dehydrogenase  57.19 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3274  acetaldehyde dehydrogenase  57.19 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0382  acetaldehyde dehydrogenase  57.19 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.708162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00309  hypothetical protein  57.19 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4660  acetaldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4748  acetaldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473939  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3526  acetaldehyde dehydrogenase  56.15 
 
 		 308 aa  318  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4744  acetaldehyde dehydrogenase  58.75 
 
 		 308 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3853  acetaldehyde dehydrogenase  56.35 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08700  acetaldehyde dehydrogenase  54.89 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5437  acetaldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.747247 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5834  acetaldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2874  acetaldehyde dehydrogenase  56.55 
 
 		 316 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1151  acetaldehyde dehydrogenase  55.45 
 
 		 313 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15120  acetaldehyde dehydrogenase  56.23 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42130  acetaldehyde dehydrogenase  56.09 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0998918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4744  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  56.7 
 
 		 289 aa  312  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5208  acetaldehyde dehydrogenase  55.37 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1650  acetaldehyde dehydrogenase  56.45 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1187  acetaldehyde dehydrogenase  53.59 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139371  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3688  acetaldehyde dehydrogenase  56.58 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2008  acetaldehyde dehydrogenase  54.1 
 
 		 315 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1244  acetaldehyde dehydrogenase  52.04 
 
 		 297 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0426  acetaldehyde dehydrogenase  56.87 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0239  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  53.4 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1478  acetaldehyde dehydrogenase  53.5 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3511  acetaldehyde dehydrogenase  54.49 
 
 		 315 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01665  acetaldehyde dehydrogenase  54.3 
 
 		 306 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0937  acetaldehyde dehydrogenase  52.55 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843977  normal  0.431333 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5135  acetaldehyde dehydrogenase  52.88 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276466  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0891  acetaldehyde dehydrogenase  45.16 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2591  acetaldehyde dehydrogenase  45.16 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2455  acetaldehyde dehydrogenase  45.16 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4834  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  44.57 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0569  acetaldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0596  acetaldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4566  acetaldehyde dehydrogenase  42.39 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  hitchhiker  0.000386347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3026  acetaldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>