101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2874 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2874  acetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 316 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3511  acetaldehyde dehydrogenase  82.43 
 
 		 315 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5824  acetaldehyde dehydrogenase  82.05 
 
 		 313 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2326  acetaldehyde dehydrogenase  81.29 
 
 		 313 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3239  acetaldehyde dehydrogenase  80.83 
 
 		 314 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.122031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1151  acetaldehyde dehydrogenase  81.01 
 
 		 313 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4538  acetaldehyde dehydrogenase  81.17 
 
 		 315 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42130  acetaldehyde dehydrogenase  78.78 
 
 		 312 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0998918  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00305  acetaldehyde dehydrogenase  79.48 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3255  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  79.48 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0415  acetaldehyde dehydrogenase  79.48 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0375  acetaldehyde dehydrogenase  79.48 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3274  acetaldehyde dehydrogenase  79.48 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0382  acetaldehyde dehydrogenase  79.48 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.708162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00309  hypothetical protein  79.48 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15120  acetaldehyde dehydrogenase  77.02 
 
 		 311 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1983  acetaldehyde dehydrogenase  76.77 
 
 		 310 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.557504 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0426  acetaldehyde dehydrogenase  78.83 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08700  acetaldehyde dehydrogenase  73.7 
 
 		 318 aa  454  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1187  acetaldehyde dehydrogenase  70.25 
 
 		 319 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139371  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0937  acetaldehyde dehydrogenase  70.51 
 
 		 315 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843977  normal  0.431333 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4924  acetaldehyde dehydrogenase  70.36 
 
 		 313 aa  434  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5208  acetaldehyde dehydrogenase  69.48 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1478  acetaldehyde dehydrogenase  68.71 
 
 		 313 aa  428  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01665  acetaldehyde dehydrogenase  71.72 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1640  acetaldehyde dehydrogenase  67.95 
 
 		 314 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  0.308557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2112  acetaldehyde dehydrogenase  67.95 
 
 		 314 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1467  acetaldehyde dehydrogenase  71.53 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7645  acetaldehyde dehydrogenase  70.17 
 
 		 314 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2883  acetaldehyde dehydrogenase  68.59 
 
 		 324 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2889  acetaldehyde dehydrogenase  69.38 
 
 		 314 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.263365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3547  acetaldehyde dehydrogenase  68.83 
 
 		 314 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1650  acetaldehyde dehydrogenase  68.81 
 
 		 314 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5135  acetaldehyde dehydrogenase  68.56 
 
 		 314 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276466  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4392  acetaldehyde dehydrogenase  67.64 
 
 		 318 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3526  acetaldehyde dehydrogenase  64.61 
 
 		 308 aa  388  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3853  acetaldehyde dehydrogenase  63.28 
 
 		 312 aa  387  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3688  acetaldehyde dehydrogenase  65.36 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3901  acetaldehyde dehydrogenase  64.29 
 
 		 308 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9114  Acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  67.97 
 
 		 325 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5437  acetaldehyde dehydrogenase  64.47 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.747247 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5834  acetaldehyde dehydrogenase  64.47 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2008  acetaldehyde dehydrogenase  64.61 
 
 		 315 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2150  acetaldehyde dehydrogenase  64.52 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4744  acetaldehyde dehydrogenase  63.49 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3802  acetaldehyde dehydrogenase  57.51 
 
 		 303 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.813125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0906  acetaldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 304 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0619702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2117  acetaldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1458  acetaldehyde dehydrogenase  58.04 
 
 		 299 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4143  acetaldehyde dehydrogenase  56.83 
 
 		 304 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.369234 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1188  acetaldehyde dehydrogenase  56.51 
 
 		 304 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0223  acetaldehyde dehydrogenase  56.19 
 
 		 302 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4082  acetaldehyde dehydrogenase  58.03 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000504143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4618  acetaldehyde dehydrogenase  56.51 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3542  acetaldehyde dehydrogenase  56.51 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.121527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3801  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  54.89 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2078  acetaldehyde dehydrogenase  57.19 
 
 		 307 aa  318  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3471  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  56.49 
 
 		 298 aa  318  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1521  acetaldehyde dehydrogenase  56.05 
 
 		 306 aa  318  9e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2461  acetaldehyde dehydrogenase  57.51 
 
 		 300 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.398437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4223  acetaldehyde dehydrogenase  55.49 
 
 		 313 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.479917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2411  acetaldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13568  acetaldehyde dehydrogenase  53.85 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3341  acetaldehyde dehydrogenase  56.55 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2033  acetaldehyde dehydrogenase  54.29 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1320  acetaldehyde dehydrogenase  54.63 
 
 		 303 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197836  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0535  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  56.13 
 
 		 303 aa  315  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2156  acetaldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 		 299 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5235  acetaldehyde dehydrogenase  54.57 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2572  acetaldehyde dehydrogenase  54.52 
 
 		 305 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1620  acetaldehyde dehydrogenase  55.19 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1391  acetaldehyde dehydrogenase  53.35 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0258079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2267  acetaldehyde dehydrogenase  55.27 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3106  acetaldehyde dehydrogenase  55.77 
 
 		 307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000261954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0455  acetaldehyde dehydrogenase  54.29 
 
 		 306 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2782  acetaldehyde dehydrogenase  55.13 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3783  acetaldehyde dehydrogenase  53.5 
 
 		 304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0703943  hitchhiker  0.00243218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1355  acetaldehyde dehydrogenase  53.5 
 
 		 304 aa  308  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000494907  decreased coverage  0.00000135829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3807  acetaldehyde dehydrogenase  52.85 
 
 		 305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2960  acetaldehyde dehydrogenase  56.51 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2297  acetaldehyde dehydrogenase  49.52 
 
 		 299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1776  acetaldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1244  acetaldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0596  acetaldehyde dehydrogenase  50.65 
 
 		 315 aa  299  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30580  acetaldehyde dehydrogenase  52.08 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000481104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0910  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  53.5 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5043  acetaldehyde dehydrogenase  52.2 
 
 		 310 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4660  acetaldehyde dehydrogenase  51.89 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4748  acetaldehyde dehydrogenase  51.89 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473939  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0440  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  55.66 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237883  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4744  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  50.97 
 
 		 289 aa  289  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3322  acetaldehyde dehydrogenase  51.58 
 
 		 307 aa  285  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0239  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  47.74 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0569  acetaldehyde dehydrogenase  40.66 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0891  acetaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2591  acetaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2455  acetaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4834  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  38.23 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4566  acetaldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  hitchhiker  0.000386347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3026  acetaldehyde dehydrogenase  37.86 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>