101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4566 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4566  acetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
295 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  hitchhiker  0.000386347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4834  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  56.25 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1776  acetaldehyde dehydrogenase  48.75 
 
 
291 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0569  acetaldehyde dehydrogenase  44.91 
 
 
297 aa  244  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0891  acetaldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2591  acetaldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2455  acetaldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1620  acetaldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
299 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1244  acetaldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
297 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3807  acetaldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
305 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2297  acetaldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
299 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3802  acetaldehyde dehydrogenase  43.11 
 
 
303 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4618  acetaldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342032  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3542  acetaldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.121527  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2267  acetaldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
303 aa  222  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0906  acetaldehyde dehydrogenase  42.4 
 
 
304 aa  219  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0619702  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1188  acetaldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
304 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625334  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2078  acetaldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
307 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2156  acetaldehyde dehydrogenase  40.14 
 
 
299 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0223  acetaldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
302 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2117  acetaldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3341  acetaldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3106  acetaldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000261954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2960  acetaldehyde dehydrogenase  43.46 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1320  acetaldehyde dehydrogenase  42.4 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197836  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2411  acetaldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1355  acetaldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000494907  decreased coverage  0.00000135829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2782  acetaldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3783  acetaldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0703943  hitchhiker  0.00243218 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4143  acetaldehyde dehydrogenase  40.64 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.369234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30580  acetaldehyde dehydrogenase  42.4 
 
 
304 aa  212  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000481104  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1458  acetaldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
299 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656772  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0455  acetaldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
306 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4744  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  42.65 
 
 
289 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3322  acetaldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
307 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2889  acetaldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
314 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.263365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0910  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  40.4 
 
 
301 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1391  acetaldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
320 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0258079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4392  acetaldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 
318 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2572  acetaldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
305 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384825  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2326  acetaldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
313 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2461  acetaldehyde dehydrogenase  40.64 
 
 
300 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.398437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2033  acetaldehyde dehydrogenase  40.28 
 
 
303 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4660  acetaldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
310 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4748  acetaldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
310 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473939  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4223  acetaldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
313 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.479917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1521  acetaldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
306 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3688  acetaldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13568  acetaldehyde dehydrogenase  41.64 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5043  acetaldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1640  acetaldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  0.308557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2112  acetaldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0440  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  39.72 
 
 
294 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237883  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1650  acetaldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
314 aa  198  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3547  acetaldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
314 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4924  acetaldehyde dehydrogenase  39.8 
 
 
313 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758356  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08700  acetaldehyde dehydrogenase  40.2 
 
 
318 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00305  acetaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3255  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  39.93 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0415  acetaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0375  acetaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3274  acetaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0382  acetaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.708162  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00309  hypothetical protein  39.93 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42130  acetaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0998918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5235  acetaldehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
306 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.264485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0239  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  41.94 
 
 
292 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5824  acetaldehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
313 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1187  acetaldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
319 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139371  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1983  acetaldehyde dehydrogenase  39.73 
 
 
310 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.557504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1467  acetaldehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
314 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4538  acetaldehyde dehydrogenase  39.33 
 
 
315 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3511  acetaldehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
315 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7645  acetaldehyde dehydrogenase  40.07 
 
 
314 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2874  acetaldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
316 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0199395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15120  acetaldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
311 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2883  acetaldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
324 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0426  acetaldehyde dehydrogenase  39.6 
 
 
316 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9114  Acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  39.29 
 
 
325 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3801  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  38.73 
 
 
302 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3853  acetaldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
312 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2008  acetaldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 
315 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0535  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  39.08 
 
 
303 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3471  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  40.07 
 
 
298 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151518  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5135  acetaldehyde dehydrogenase  39.73 
 
 
314 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276466  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2150  acetaldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 
314 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3026  acetaldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 
295 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5437  acetaldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.747247 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5834  acetaldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1151  acetaldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923632  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3239  acetaldehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
314 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.122031  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3901  acetaldehyde dehydrogenase  40 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4744  acetaldehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
308 aa  181  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4082  acetaldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
315 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0937  acetaldehyde dehydrogenase  36.27 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843977  normal  0.431333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1478  acetaldehyde dehydrogenase  36.82 
 
 
313 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5208  acetaldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
314 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_003296  RS01665  acetaldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
306 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188188  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3526  acetaldehyde dehydrogenase  39.39 
 
 
308 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0596  acetaldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 
315 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>