100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1478 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1478  acetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 313 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0937  acetaldehyde dehydrogenase  84.24 
 
 		 315 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843977  normal  0.431333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5824  acetaldehyde dehydrogenase  70.87 
 
 		 313 aa  441  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08700  acetaldehyde dehydrogenase  71.05 
 
 		 318 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2326  acetaldehyde dehydrogenase  69.35 
 
 		 313 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42130  acetaldehyde dehydrogenase  68.39 
 
 		 312 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0998918  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2874  acetaldehyde dehydrogenase  68.71 
 
 		 316 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4538  acetaldehyde dehydrogenase  69.93 
 
 		 315 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15120  acetaldehyde dehydrogenase  67.2 
 
 		 311 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3255  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  67.63 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4924  acetaldehyde dehydrogenase  68.4 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758356  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00305  acetaldehyde dehydrogenase  67.63 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1151  acetaldehyde dehydrogenase  69.06 
 
 		 313 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0415  acetaldehyde dehydrogenase  67.63 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0375  acetaldehyde dehydrogenase  67.63 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3274  acetaldehyde dehydrogenase  67.63 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0382  acetaldehyde dehydrogenase  67.63 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.708162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00309  hypothetical protein  67.63 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5135  acetaldehyde dehydrogenase  71.09 
 
 		 314 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276466  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3511  acetaldehyde dehydrogenase  67.42 
 
 		 315 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3239  acetaldehyde dehydrogenase  69.13 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.122031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1187  acetaldehyde dehydrogenase  68.95 
 
 		 319 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139371  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1983  acetaldehyde dehydrogenase  66.23 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.557504 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0426  acetaldehyde dehydrogenase  67.31 
 
 		 316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5208  acetaldehyde dehydrogenase  67.55 
 
 		 314 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1640  acetaldehyde dehydrogenase  62.94 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  0.308557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2112  acetaldehyde dehydrogenase  62.94 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3688  acetaldehyde dehydrogenase  64.19 
 
 		 311 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3853  acetaldehyde dehydrogenase  61.66 
 
 		 312 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01665  acetaldehyde dehydrogenase  67.92 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2883  acetaldehyde dehydrogenase  62.42 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3547  acetaldehyde dehydrogenase  64.17 
 
 		 314 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1467  acetaldehyde dehydrogenase  65.99 
 
 		 314 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7645  acetaldehyde dehydrogenase  64.75 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2889  acetaldehyde dehydrogenase  63.73 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.263365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1650  acetaldehyde dehydrogenase  64.24 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2008  acetaldehyde dehydrogenase  62.9 
 
 		 315 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3526  acetaldehyde dehydrogenase  60.86 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3901  acetaldehyde dehydrogenase  59.74 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2150  acetaldehyde dehydrogenase  62.21 
 
 		 314 aa  364  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9114  Acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  61.26 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4392  acetaldehyde dehydrogenase  61.83 
 
 		 318 aa  361  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5834  acetaldehyde dehydrogenase  57.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5437  acetaldehyde dehydrogenase  57.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.747247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4744  acetaldehyde dehydrogenase  60.33 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0223  acetaldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 		 302 aa  308  9e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2782  acetaldehyde dehydrogenase  54.78 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0906  acetaldehyde dehydrogenase  56.86 
 
 		 304 aa  305  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0619702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2411  acetaldehyde dehydrogenase  52.09 
 
 		 305 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2297  acetaldehyde dehydrogenase  52.4 
 
 		 299 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2117  acetaldehyde dehydrogenase  55.63 
 
 		 307 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2461  acetaldehyde dehydrogenase  57.98 
 
 		 300 aa  302  6.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.398437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2156  acetaldehyde dehydrogenase  53.27 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3341  acetaldehyde dehydrogenase  53.5 
 
 		 305 aa  299  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2033  acetaldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0596  acetaldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 		 315 aa  299  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1391  acetaldehyde dehydrogenase  54.26 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0258079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1521  acetaldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1188  acetaldehyde dehydrogenase  54.84 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3106  acetaldehyde dehydrogenase  54.86 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000261954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3471  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  55.97 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151518  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1458  acetaldehyde dehydrogenase  54.11 
 
 		 299 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4143  acetaldehyde dehydrogenase  54.19 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.369234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5235  acetaldehyde dehydrogenase  53.02 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13568  acetaldehyde dehydrogenase  53.09 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208142 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1620  acetaldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2078  acetaldehyde dehydrogenase  54.66 
 
 		 307 aa  292  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4618  acetaldehyde dehydrogenase  52.72 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3542  acetaldehyde dehydrogenase  52.72 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.121527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4223  acetaldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.479917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2572  acetaldehyde dehydrogenase  50.48 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4082  acetaldehyde dehydrogenase  54.42 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000504143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3802  acetaldehyde dehydrogenase  52.24 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.813125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3801  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  53.72 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2267  acetaldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 		 303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1320  acetaldehyde dehydrogenase  52.73 
 
 		 303 aa  288  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197836  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0535  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  52.68 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3783  acetaldehyde dehydrogenase  51.45 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0703943  hitchhiker  0.00243218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30580  acetaldehyde dehydrogenase  53.7 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000481104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0455  acetaldehyde dehydrogenase  52.56 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3807  acetaldehyde dehydrogenase  52.09 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1776  acetaldehyde dehydrogenase  49.52 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1355  acetaldehyde dehydrogenase  51.13 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000494907  decreased coverage  0.00000135829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5043  acetaldehyde dehydrogenase  52.56 
 
 		 310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4748  acetaldehyde dehydrogenase  52.56 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473939  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4660  acetaldehyde dehydrogenase  52.56 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2960  acetaldehyde dehydrogenase  54.52 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4744  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  48.72 
 
 		 289 aa  281  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0440  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  51.3 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237883  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3322  acetaldehyde dehydrogenase  49.03 
 
 		 307 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1244  acetaldehyde dehydrogenase  45.48 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0239  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  46.43 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0910  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  49.68 
 
 		 301 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2455  acetaldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0891  acetaldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2591  acetaldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0569  acetaldehyde dehydrogenase  41.47 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4834  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  39.16 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3026  acetaldehyde dehydrogenase  35.81 
 
 		 295 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4566  acetaldehyde dehydrogenase  36.68 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  hitchhiker  0.000386347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>