20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0667 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0667  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  209  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0694  auxin efflux carrier  94.17 
 
 		 347 aa  199  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 309 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  36.51 
 
 		 305 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  38.46 
 
 		 325 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  31.46 
 
 		 299 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  35 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  33.87 
 
 		 295 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.51 
 
 		 320 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  29.85 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 		 320 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  28 
 
 		 322 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  37.88 
 
 		 309 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  36.23 
 
 		 321 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  35.19 
 
 		 325 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  37.88 
 
 		 309 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  37.88 
 
 		 309 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  32.73 
 
 		 332 aa  40.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  37.93 
 
 		 318 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  37.5 
 
 		 306 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>