More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4048 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_4048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.44 
 
 
301 aa  417  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1690  oligogalacturonide ABC tansporter, permease protein  61.92 
 
 
306 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.064753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.92 
 
 
306 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2646  oligogalacturonide ABC tansporter, permease  61.92 
 
 
306 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.559892  normal  0.131938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.41 
 
 
303 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.07 
 
 
300 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 
300 aa  353  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.79 
 
 
300 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.72 
 
 
301 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.207694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.72 
 
 
301 aa  348  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.662638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.96 
 
 
285 aa  332  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
289 aa  304  9.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00195134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
306 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
280 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.697078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
308 aa  265  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
306 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  42.09 
 
 
293 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1703  putative transport system permease ABC transporter protein  39.3 
 
 
292 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.757038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
279 aa  251  7e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0806983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
295 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.8 
 
 
304 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.942295  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
309 aa  247  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
292 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000934569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.79 
 
 
312 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 
305 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
292 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.924355  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
289 aa  245  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
281 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
314 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00328886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
313 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
305 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0303683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
284 aa  237  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.36 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
300 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.303793  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
308 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
286 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 
293 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
297 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.807172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
292 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.843262 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
283 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.372936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
274 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330294  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
277 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
292 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.660216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
293 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000740706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
280 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
273 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
299 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
302 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
299 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
296 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
301 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
300 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
302 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
299 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0352539  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
307 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
279 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
291 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
291 aa  178  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
297 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
278 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
279 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
298 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
277 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
278 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
305 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00998336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  36.03 
 
 
277 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
381 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
275 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
308 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 
277 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
300 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
305 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
290 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.7 
 
 
278 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
354 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  32.16 
 
 
276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
295 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
281 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  30.55 
 
 
272 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
272 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  33.46 
 
 
273 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.9 
 
 
275 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
275 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
270 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
285 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
290 aa  158  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
268 aa  158  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
273 aa  158  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
301 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
276 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
296 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000371485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>