39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1799 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  100 
 
 
216 aa  431  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  67.13 
 
 
216 aa  297  7e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0390  50S ribosomal protein L15e  60.4 
 
 
187 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1500  50S ribosomal protein L15e  54.65 
 
 
194 aa  187  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0798425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2499  50S ribosomal protein L15e  54.64 
 
 
199 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0442264  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1681  50S ribosomal protein L15e  54.71 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0192  50S ribosomal protein L15e  50 
 
 
197 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1369  50S ribosomal protein L15e  52.6 
 
 
203 aa  179  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1375  50S ribosomal protein L15e  54.07 
 
 
194 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1126  Ribosomal protein L15e  55.68 
 
 
199 aa  175  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.032703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0655  50S ribosomal protein L15e  54.07 
 
 
194 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.310615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1301  50S ribosomal protein L15e  54.07 
 
 
194 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.24879  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1344  50S ribosomal protein L15e  50 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.243735  hitchhiker  0.000262392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2385  50S ribosomal protein L15e  51.37 
 
 
196 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0277  Ribosomal protein L15e  51.72 
 
 
196 aa  170  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0240677 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0413  50S ribosomal protein L15e  52 
 
 
196 aa  168  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1309  50S ribosomal protein L15e  54.07 
 
 
219 aa  168  6e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0960  Ribosomal protein L15e  50 
 
 
196 aa  168  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.359335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2795  Ribosomal protein L15e  50 
 
 
196 aa  167  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1892  50S ribosomal protein L15e  55.7 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.551367 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1666  50S ribosomal protein L15e  57.81 
 
 
189 aa  157  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0270975 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14085  Ribosomal protein L15, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.71 
 
 
204 aa  153  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1751  50S ribosomal protein L15e  56.16 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0711  50S ribosomal protein L15e  50 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2279  50S ribosomal protein L15e  52.98 
 
 
196 aa  151  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0767  50S ribosomal protein L15e  54.79 
 
 
188 aa  150  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.599543 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25714  predicted protein  40.78 
 
 
205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2529  50S ribosomal protein L15e  49.4 
 
 
192 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1825  50S ribosomal protein L15e  49.7 
 
 
196 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06940  structural constituent of ribosome, putative  43.18 
 
 
201 aa  137  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1254  50S ribosomal protein L15e  44.53 
 
 
154 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85750  60S ribosomal protein L15-B (YL10) (L13) (RP15R) (YP18)  44.44 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.162573 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00445  60S ribosomal protein L15 (Broad)  42.05 
 
 
203 aa  118  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.577151  normal  0.137113 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0678  ribosomal protein L13  47.14 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1980  ribosomal protein L13  40.24 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.280522  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0588  50S ribosomal protein L13E  57.14 
 
 
157 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1663  ribosomal protein L13  53.06 
 
 
160 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.129766  hitchhiker  0.00645105 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0690  ribosomal protein L13  51.02 
 
 
154 aa  46.2  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0734  ribosomal protein L13  48.98 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0451901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>