12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1663 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1663  ribosomal protein L13  100 
 
 
160 aa  317  5e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.129766  hitchhiker  0.00645105 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0588  50S ribosomal protein L13E  73.72 
 
 
157 aa  245  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1980  ribosomal protein L13  65.82 
 
 
158 aa  234  4e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.280522  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0690  ribosomal protein L13  70.78 
 
 
154 aa  229  8.000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0734  ribosomal protein L13  51.02 
 
 
157 aa  132  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0451901  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0678  ribosomal protein L13  47.54 
 
 
144 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0248  Ribosomal protein L13e  58.7 
 
 
110 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48494  60S ribosomal protein L13  40.3 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0593553 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  53.06 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  59.18 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15619  predicted protein  29.76 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15603  Ribosomal protein L13, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  47.17 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>