10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0690 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0690  ribosomal protein L13  100 
 
 
154 aa  307  4e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0588  50S ribosomal protein L13E  74.83 
 
 
157 aa  235  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1663  ribosomal protein L13  70.78 
 
 
160 aa  229  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.129766  hitchhiker  0.00645105 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1980  ribosomal protein L13  71.43 
 
 
158 aa  230  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.280522  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0734  ribosomal protein L13  51.37 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0451901  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0678  ribosomal protein L13  49.64 
 
 
144 aa  124  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0248  Ribosomal protein L13e  44.93 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48494  60S ribosomal protein L13  38.36 
 
 
202 aa  48.9  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0593553 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  51.02 
 
 
216 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15619  predicted protein  32.95 
 
 
171 aa  40.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>