11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0588 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0588  50S ribosomal protein L13E  100 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1663  ribosomal protein L13  73.72 
 
 		 160 aa  245  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.129766  hitchhiker  0.00645105 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1980  ribosomal protein L13  72.73 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.280522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0690  ribosomal protein L13  74.83 
 
 		 154 aa  235  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0734  ribosomal protein L13  53.74 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0451901  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0678  ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0248  Ribosomal protein L13e  47.06 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  57.14 
 
 		 216 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48494  60S ribosomal protein L13  39.71 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  63.27 
 
 		 216 aa  44.3  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07003  60S ribosomal protein L13 (AFU_orthologue; AFUA_4G04460)  36.67 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>