10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0678 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0678  ribosomal protein L13  100 
 
 		 144 aa  288  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1980  ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.280522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0734  ribosomal protein L13  48.34 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0451901  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0588  50S ribosomal protein L13E  49.65 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0690  ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 154 aa  124  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1663  ribosomal protein L13  47.54 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.129766  hitchhiker  0.00645105 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48494  60S ribosomal protein L13  49.12 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  47.14 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0248  Ribosomal protein L13e  42.03 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01020  ribosomal protein L13, putative  43.86 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>