33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1254 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1254  50S ribosomal protein L15e  100 
 
 		 154 aa  315  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  47.73 
 
 		 216 aa  139  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2795  Ribosomal protein L15e  52.54 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0960  Ribosomal protein L15e  52.54 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.359335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2499  50S ribosomal protein L15e  50.79 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0442264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0390  50S ribosomal protein L15e  45.99 
 
 		 187 aa  131  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0192  50S ribosomal protein L15e  48.78 
 
 		 197 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2385  50S ribosomal protein L15e  47.97 
 
 		 196 aa  128  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1369  50S ribosomal protein L15e  45.53 
 
 		 203 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1344  50S ribosomal protein L15e  48.8 
 
 		 194 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.243735  hitchhiker  0.000262392 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0277  Ribosomal protein L15e  48.72 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0240677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1681  50S ribosomal protein L15e  45.6 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1126  Ribosomal protein L15e  47.15 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.032703  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1500  50S ribosomal protein L15e  47.46 
 
 		 194 aa  121  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0798425  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0413  50S ribosomal protein L15e  47.01 
 
 		 196 aa  120  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547209 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1375  50S ribosomal protein L15e  46.72 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0655  50S ribosomal protein L15e  45.53 
 
 		 194 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.310615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1301  50S ribosomal protein L15e  45.53 
 
 		 194 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.24879  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  44.53 
 
 		 216 aa  117  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1892  50S ribosomal protein L15e  44.8 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.551367 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1309  50S ribosomal protein L15e  50.82 
 
 		 219 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1666  50S ribosomal protein L15e  42.98 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0270975 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2279  50S ribosomal protein L15e  46.4 
 
 		 196 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1751  50S ribosomal protein L15e  45.45 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0711  50S ribosomal protein L15e  39.67 
 
 		 193 aa  103  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2529  50S ribosomal protein L15e  44.8 
 
 		 192 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0767  50S ribosomal protein L15e  43.8 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.599543 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25714  predicted protein  39.84 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1825  50S ribosomal protein L15e  47.2 
 
 		 196 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06940  structural constituent of ribosome, putative  39.68 
 
 		 201 aa  94  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14085  Ribosomal protein L15, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.96 
 
 		 204 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00445  60S ribosomal protein L15 (Broad)  42.28 
 
 		 203 aa  85.9  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.577151  normal  0.137113 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85750  60S ribosomal protein L15-B (YL10) (L13) (RP15R) (YP18)  39.34 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.162573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>