33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2529 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2529  50S ribosomal protein L15e  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1681  50S ribosomal protein L15e  77.08 
 
 
196 aa  288  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1344  50S ribosomal protein L15e  71.88 
 
 
194 aa  277  7e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.243735  hitchhiker  0.000262392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0192  50S ribosomal protein L15e  68.75 
 
 
197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1825  50S ribosomal protein L15e  77.6 
 
 
196 aa  259  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2499  50S ribosomal protein L15e  64.92 
 
 
199 aa  254  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0442264  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1369  50S ribosomal protein L15e  63.02 
 
 
203 aa  246  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2279  50S ribosomal protein L15e  72.4 
 
 
196 aa  244  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1301  50S ribosomal protein L15e  60.94 
 
 
194 aa  231  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.24879  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0655  50S ribosomal protein L15e  60.42 
 
 
194 aa  229  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.310615  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1500  50S ribosomal protein L15e  58.85 
 
 
194 aa  225  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0798425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1309  50S ribosomal protein L15e  60.42 
 
 
219 aa  224  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1375  50S ribosomal protein L15e  60.42 
 
 
194 aa  224  7e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0413  50S ribosomal protein L15e  55.73 
 
 
196 aa  222  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2385  50S ribosomal protein L15e  53.12 
 
 
196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0277  Ribosomal protein L15e  52.36 
 
 
196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0240677 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0960  Ribosomal protein L15e  51.91 
 
 
196 aa  205  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.359335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2795  Ribosomal protein L15e  50.82 
 
 
196 aa  203  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1126  Ribosomal protein L15e  56.15 
 
 
199 aa  202  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.032703  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  50 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  48.89 
 
 
216 aa  153  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0390  50S ribosomal protein L15e  49.67 
 
 
187 aa  151  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14085  Ribosomal protein L15, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  44.21 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25714  predicted protein  42.05 
 
 
205 aa  140  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329815  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1892  50S ribosomal protein L15e  46.15 
 
 
185 aa  124  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.551367 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06940  structural constituent of ribosome, putative  37.99 
 
 
201 aa  118  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1254  50S ribosomal protein L15e  44.8 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1666  50S ribosomal protein L15e  46.61 
 
 
189 aa  115  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0270975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0767  50S ribosomal protein L15e  52.54 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.599543 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00445  60S ribosomal protein L15 (Broad)  43.02 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.577151  normal  0.137113 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0711  50S ribosomal protein L15e  44.92 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1751  50S ribosomal protein L15e  49.15 
 
 
190 aa  109  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85750  60S ribosomal protein L15-B (YL10) (L13) (RP15R) (YP18)  40.8 
 
 
204 aa  101  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.162573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>