33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0413 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0413  50S ribosomal protein L15e  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2385  50S ribosomal protein L15e  75.92 
 
 
196 aa  305  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0960  Ribosomal protein L15e  77.37 
 
 
196 aa  302  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.359335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2795  Ribosomal protein L15e  76.84 
 
 
196 aa  301  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0277  Ribosomal protein L15e  73.98 
 
 
196 aa  295  3e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0240677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0192  50S ribosomal protein L15e  63.35 
 
 
197 aa  256  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1369  50S ribosomal protein L15e  60.82 
 
 
203 aa  237  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2499  50S ribosomal protein L15e  56.63 
 
 
199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0442264  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1500  50S ribosomal protein L15e  54.92 
 
 
194 aa  227  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0798425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1301  50S ribosomal protein L15e  58.55 
 
 
194 aa  225  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.24879  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1375  50S ribosomal protein L15e  58.03 
 
 
194 aa  223  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0655  50S ribosomal protein L15e  58.03 
 
 
194 aa  223  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.310615  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1344  50S ribosomal protein L15e  53.57 
 
 
194 aa  223  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.243735  hitchhiker  0.000262392 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1126  Ribosomal protein L15e  58.95 
 
 
199 aa  221  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.032703  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1681  50S ribosomal protein L15e  59.18 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1309  50S ribosomal protein L15e  57.51 
 
 
219 aa  210  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2279  50S ribosomal protein L15e  60.2 
 
 
196 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1825  50S ribosomal protein L15e  57.65 
 
 
196 aa  189  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2529  50S ribosomal protein L15e  55.73 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  53.18 
 
 
216 aa  177  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25714  predicted protein  48 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329815  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0390  50S ribosomal protein L15e  52.7 
 
 
187 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  52 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14085  Ribosomal protein L15, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.93 
 
 
204 aa  149  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06940  structural constituent of ribosome, putative  47.06 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1892  50S ribosomal protein L15e  47.65 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.551367 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85750  60S ribosomal protein L15-B (YL10) (L13) (RP15R) (YP18)  47.06 
 
 
204 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.162573 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1666  50S ribosomal protein L15e  53.91 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0270975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1751  50S ribosomal protein L15e  51.02 
 
 
190 aa  122  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00445  60S ribosomal protein L15 (Broad)  50.34 
 
 
203 aa  121  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.577151  normal  0.137113 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1254  50S ribosomal protein L15e  47.01 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0711  50S ribosomal protein L15e  46.26 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0767  50S ribosomal protein L15e  49.66 
 
 
188 aa  119  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.599543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>