33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2499 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2499  50S ribosomal protein L15e  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0442264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0192  50S ribosomal protein L15e  74.49 
 
 		 197 aa  299  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2385  50S ribosomal protein L15e  60.71 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1369  50S ribosomal protein L15e  62.56 
 
 		 203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1681  50S ribosomal protein L15e  65.31 
 
 		 196 aa  248  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0277  Ribosomal protein L15e  57.14 
 
 		 196 aa  240  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0240677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1301  50S ribosomal protein L15e  64.25 
 
 		 194 aa  240  9e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.24879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1344  50S ribosomal protein L15e  61.22 
 
 		 194 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.243735  hitchhiker  0.000262392 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0655  50S ribosomal protein L15e  63.73 
 
 		 194 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.310615  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0960  Ribosomal protein L15e  57.14 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.359335  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1500  50S ribosomal protein L15e  60.62 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0798425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2795  Ribosomal protein L15e  56.12 
 
 		 196 aa  234  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1375  50S ribosomal protein L15e  64.36 
 
 		 194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0413  50S ribosomal protein L15e  56.63 
 
 		 196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1309  50S ribosomal protein L15e  63.3 
 
 		 219 aa  225  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2279  50S ribosomal protein L15e  66.84 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1825  50S ribosomal protein L15e  65.31 
 
 		 196 aa  221  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2529  50S ribosomal protein L15e  64.92 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1126  Ribosomal protein L15e  52.53 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.032703  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  51.91 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  54.64 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0390  50S ribosomal protein L15e  52.7 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14085  Ribosomal protein L15, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.41 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1892  50S ribosomal protein L15e  50.34 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.551367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1254  50S ribosomal protein L15e  50.79 
 
 		 154 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25714  predicted protein  40.34 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329815  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1666  50S ribosomal protein L15e  50.41 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0270975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0711  50S ribosomal protein L15e  41.51 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1751  50S ribosomal protein L15e  52.89 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0767  50S ribosomal protein L15e  51.24 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.599543 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06940  structural constituent of ribosome, putative  36.9 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00445  60S ribosomal protein L15 (Broad)  45.1 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.577151  normal  0.137113 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85750  60S ribosomal protein L15-B (YL10) (L13) (RP15R) (YP18)  41.04 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.162573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>