33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1309 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1309  50S ribosomal protein L15e  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1375  50S ribosomal protein L15e  89.69 
 
 
194 aa  341  4e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0655  50S ribosomal protein L15e  87.63 
 
 
194 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.310615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1301  50S ribosomal protein L15e  87.11 
 
 
194 aa  333  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.24879  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1500  50S ribosomal protein L15e  75.92 
 
 
194 aa  299  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0798425  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0192  50S ribosomal protein L15e  62.69 
 
 
197 aa  255  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2499  50S ribosomal protein L15e  63.3 
 
 
199 aa  249  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0442264  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1681  50S ribosomal protein L15e  62.69 
 
 
196 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1369  50S ribosomal protein L15e  58.55 
 
 
203 aa  236  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0413  50S ribosomal protein L15e  57.51 
 
 
196 aa  236  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547209 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0277  Ribosomal protein L15e  56.38 
 
 
196 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0240677 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1344  50S ribosomal protein L15e  61.08 
 
 
194 aa  230  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.243735  hitchhiker  0.000262392 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2279  50S ribosomal protein L15e  66.84 
 
 
196 aa  226  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1126  Ribosomal protein L15e  61.9 
 
 
199 aa  223  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.032703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0960  Ribosomal protein L15e  56.52 
 
 
196 aa  223  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.359335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2795  Ribosomal protein L15e  55.98 
 
 
196 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2385  50S ribosomal protein L15e  54.89 
 
 
196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2529  50S ribosomal protein L15e  60.42 
 
 
192 aa  209  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1825  50S ribosomal protein L15e  63.21 
 
 
196 aa  204  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  48.84 
 
 
216 aa  177  8e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  54.07 
 
 
216 aa  177  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0390  50S ribosomal protein L15e  51.61 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14085  Ribosomal protein L15, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.55 
 
 
204 aa  169  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25714  predicted protein  44.75 
 
 
205 aa  161  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329815  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1892  50S ribosomal protein L15e  48.32 
 
 
185 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.551367 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06940  structural constituent of ribosome, putative  41.24 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1666  50S ribosomal protein L15e  46.58 
 
 
189 aa  137  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0270975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0711  50S ribosomal protein L15e  45.21 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1751  50S ribosomal protein L15e  50 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1254  50S ribosomal protein L15e  50.82 
 
 
154 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85750  60S ribosomal protein L15-B (YL10) (L13) (RP15R) (YP18)  43.68 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.162573 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00445  60S ribosomal protein L15 (Broad)  43.1 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.577151  normal  0.137113 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0767  50S ribosomal protein L15e  46.58 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.599543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>